hTFtarget收录了659个转录因子的chip-seq实验样本和699个转录因子的高可信度DNA结合序列，是目前最全面的人类转录因子数据库。进入官网：https://guolab.wchscu.cn/hTFtarget/#!/，网站分为TF、Target、Peak、Co-regularion、Co-association和Prediction六个模块。小编将依次介绍各个模块的功能和使用方法。TF 有确定的目...
左侧文本框输入目的序列,选择感兴趣的转录因子,右侧文本框中则会显示选中的转录因子,点击“Predict”,页面下方即可显示预测的结合位点。预测结果中,绿色表示预测结果来自TRANSFAC/JASPAR/HOCOMOCO数据库,红色表示预测结果来自hTFtarget。 至此,hTFtarget的使用方法介绍结束,小伙伴们可以通过网站菜单栏中的Document模块查看功能模...
hTFtarget收录了人类TF-target目前最全面的资料,整合大规模的人类转录因子靶基因数据,综合考虑转录因子结合位点及基因组表观修饰状态对转录因子结合的影响,采用统一预测方法预测了相对可靠的人类转录因子靶基因,并构建了开源的人类转录因子靶基因数据库,同时分析了转录因子的细胞系特异性调控、转录因子间的协作调控等,为TF...
在hTFtarget数据库中进行数据检索时,采用有效的检索策略可以提高数据获取的准确性和效率。首先,明确你的研究目标和需求,选择合适的检索条件。例如,如果你关注的是某一特定疾病中的转录因子,可以先通过关键词搜索相关文献,然后在hTFtarget数据库中检索对应的TF和靶基因信息。其次,利用数据库提供的高级搜索功能,如布尔运算符...
1、hTFtarget: 一个全面的人类转录因子靶基因数据库要点介绍研究问题:人类转录因子靶基因的鉴定及其数据库的构建和应用研究方法:整合大规模的人类转录因子靶基因数据,综合考虑转录因子结合位点及基因组表观修饰状态对转录因子结合的影响,采用统一预测方法预测了相对可靠的人类转录因子靶基因,并构建了开源的人类转录因子靶...
hTFtarget收录了699个转录因子的详细信息，包括2737个TFBS序列，并使用BETA模型量化调控能力。它结合ROADMAP表观修饰状态，通过ChIP-Seq分析和TFBS扫描确保预测的准确性。该数据库由中国华中科技大学郭安源教授团队开发和维护，功能丰富，包括浏览TF靶基因、探索TF调控、查询ChIP-Seq样本、分析TF协同调控等，方便...
hTFtarget收录了659个转录因子的chip-seq实验样本和699个转录因子的高可信度DNA结合序列,是目前最全面的人类转录因子数据库。 进入官网:https://guolab.wchscu.cn/hTFtarget/#!/,网站分为TF、Target、Peak、Co-regularion、Co-association和Prediction六个模块。小编将依次介绍各个模块的功能和使用方法。
hTFtarget收录了659个转录因子的chip-seq实验样本和699个转录因子的高可信度DNA结合序列,是目前最全面的人类转录因子数据库。 进入官网:https://guolab.wchscu.cn/hTFtarget/#!/,网站分为TF、Target、Peak、Co-regularion、Co-association和Prediction六个模块。小编将依次介绍各个模块的功能和使用方法。
上期主要介绍了hTFtarget的TF和Target两个模块的使用方法,本期将介绍Peak、Co-regulation、Co-association、Prediction四个模块的使用方法。 Peak 该模块可查看TF的ChIP-Seq峰。Peak模块页面如下,有细胞系和转录因子两个检索框,若只确定了其中一个条件,选择对应的检索框输入关键词即可。
至此,hTFtarget的使用方法介绍结束,小伙伴们可以通过网站菜单栏中的Document模块查看功能模块的详细内容,包括数据来源,预测算法等。下期将介绍动物转录因子数据库AnimalTFDB,感兴趣的小伙伴可以留意一下哦~ 汉恒专营工具病毒十余载,如有基因调控相关技术问题,欢迎随时咨询!