hTFtarget收录了659个转录因子的chip-seq实验样本和699个转录因子的高可信度DNA结合序列,是目前最全面的人类转录因子数据库。进入官网:https://guolab.wchscu.cn/hTFtarget/#!/,网站分为TF、Target、Peak、Co-regularion、Co-association和Prediction六个模块。小编将依次介绍各个模块的功能和使用方法。TF 有确定的目...
hTFtarget采用指数衰减的BETA模型量化转录因子对靶基因的调控能力,并结合ROADMAP表观修饰状态来准确预测这些转录因子的潜在靶基因。而且hTFtarget应用了两种不同的策略来检测TF-target信心,包括ChIP-Seq数据分析和转录因子结合位点(TFBS)扫描。数据库由华中科技大学郭安源教授团队研发并维护。 hTFtarget http://bioinfo.life....
hTFtarget收录了699个转录因子的详细信息,包括2737个TFBS序列,并使用BETA模型量化调控能力。它结合ROADMAP表观修饰状态,通过ChIP-Seq分析和TFBS扫描确保预测的准确性。该数据库由中国华中科技大学郭安源教授团队开发和维护,功能丰富,包括浏览TF靶基因、探索TF调控、查询ChIP-Seq样本、分析TF协同调控等,方便...
hTFtarget: 一个全面的人类转录因子靶基因数据库要点介绍研究问题:人类转录因子靶基因的鉴定及其数据库的构建和应用研究方法:整合大规模的人类转录因子靶基因数据,综合考虑转录因子结合位点及基因组表观修饰状态对转录因子结合的影响,采用统一
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hTFtarget收录了人类TF-target目前最全面的资料,整合大规模的人类转录因子靶基因数据,综合考虑转录因子结合位点及基因组表观修饰状态对转录因子结合的影响,采用统一预测方法预测了相对可靠的人类转录因子靶基因,并构建了开源的人类转录因子靶基因数据库,同时分析了转录因子的细胞系特异性调控、转录因子间的协作调控等,为TF...