输出定向选项 -o <f> : direct output to file <f>, not stdout 输出到文件中,而不是到标准输出 -A <f> : save multiple alignment of all hits to file <f> 将所有命中的多序列比对输出到文件 --tblout <f> : save parseable table of per-sequence hits to file <f> 保存每个序列的命中结果的...
hmmpress也是hmmer3下面的一个程序。seqfile为输入的蛋白质序列,默认为fasta格式。 hmmscan还有很多参数可供使用,包括控制输出的参数,比如-o, 将比对结果输出到指定文件,通过指定E-value, bit score控制搜索结果,–cpu指定使用的cpu数目,–qformat指定输入蛋白质序列的格式等,可以使用-h参数参看参数帮助说明。 hhsearc...
基于序列划分策略的Hmmsearch程序两级并行实现 维普资讯 http://www.cqvip.com
Alignmentsforeach domain:==domain1score:10.7bits;conditional E-value:0.00082target.test.aln212lrelLvecaeavsednlelaqellarlselsSpegn.pseRlaayfaeaLear263+lL++ca+a++++l+a ll+l+++Rl++yfa+aL r test.query01G22939ALRLLLSCAKAIEDGDLKSADALLHIILVLADERPYlYESRLVKYFADALVRR615689***9999988887889***987PP...