基于序列划分策略的Hmmsearch程序两级并行实现 维普资讯 http://www.cqvip.com
t(Ik+1,Ik+1) … 下个矩阵块。在后续计算中每次只须读出一行, 实现滑动窗口方式的读数,减少了读数时间。 图3 状态迁移概率矩阵滑动窗口实现示意图 对于状态概率数据,设计采用数据传递的 流水线级数 方式读取。例如,在 V(i,k)计算中,cell-PE 将计 算结果 M(i,k)写入局部存储器,在 V(i+1,k...
--domT <x> : report domains >= this score cutoff in output 在结果中报告大于这个分数的domain Options controlling inclusion (significance) thresholds: 控制包含(显著性)阈值的参数: --incE <x> : consider sequences <= this E-value threshold as significant ...