HLA分型 HLA-typing 一、HLA背景介绍 HLA(Human Leukocyte Antigen,人类白细胞抗原)是人类的主要组织相容性复合体(Major Histocompatibility Complex, MHC)表达的产物,其编码的分子参与抗原递呈,制约细胞间相互识别及诱导免疫应答。 HLA位于人类6号染色体短臂一段约3.6M的参与免疫反应的多态性区域,HLA复合体可以分为...
(4)基于测序的分型方法:SBT(Sequencing-Based Typing)是用两侧引物对HLA基因多态性的区域进行PCR扩增,然后对扩增产物进行Sanger测序,获得HLA等位基因序列从而进行分型。SBT技术是目前HLA基因分型的金标准,具有分辨率高、准确性高以及特异性强的特点,但其针对HLA-I类基因的第2、3、4外显子以及HLA-II类基因第2...
HLA复合体的遗传特点 1复等位基因2共显性遗传3极高的多态性 截至2009年10月 HLAI类基因-抗原结构特点 HLAII类基因-抗原结构特点 2HLA分型技术 血清学水平 基因水平 SSP (sequencespecificprimer)SSO (sequencespecificoligonucleotide)SBT (sequence-basedtyping)HLA测序分型(SBT)的PCR策略 HLA–A、C HLA–B HLA...
纳昂达曾于 2019 年推出 HLAtyping Panel v1.0,以杂交捕获的方式对 HLA 基因编码区靶向测序,其特点在于:以参考基因组序列为基础设计编码区探针,再考察不同型别的序列差异,补充多态性探针,解决了 HLA 序列多态性超过单条探针容错能力的问题,实现了对所有型别编码区的有效捕获。区别于依赖 PCR 的富集方式,杂交捕获不...
HLA Typing PCR-SSP检测HLA-B27 一、实验目的 掌握PCR-SSP的原理,了解HLA基因分型的基本方法。二、实验原理 编码HLA的基因具有高度的多态性,每一个基因座位上有众多的复等位基因,而每一个等位基因都有其各自的DNA序列,因此可用相应的序列特异性引物(sequencespecificprimers,SSP)进行扩增。通过控制PCR反应条件...
图3. HLAtyping Panel双平台捕获结果 04 Illumina平台HLA分型表现 我们首先使用 HLA-HD、Athlates 和 OptiType 对 HLA 的 I 型和 II 型共计 12 个标准品分析,具体结果见表 3。HLA-HD 和 Athlates 比 OptiType 的 HLA I 型分型更加准确,两者仅在 A 基因的 24 个 allele 上错误分型 1 个位点,而 OptiT...
[6]Dilthey AT, Mentzer AJ, Carapito R, et al. HLA*LA-HLA typing from linearly projected graph alignments[J]. Bioinformatics. 2019,35(21):4394-4396. [7]Nishizawa A, Kumada K, Tateno K, et al. Analysis of HLA-G...
组织抗原分型(HLA-typing)又称为组织型监定(tissue typing)分为第一型(HLA-A, B, C)和第二型(HLA, DP, DQ, DR) 都位於人类的 … tw.myblog.yahoo.com|基于17个网页 2. 人类白血球抗原配对 ...热烈回响,尤其 我将台大肾脏移植手术中,所获得关於人类白血球抗原配对(HLA-typing)的知 识,首次介绍给...
目前实验室HLA分型大多为基因分型方法,主要包括低分辨水平的PCR-序列特异性引物基因扩增法(sequence specific primer, SSP)、中分辨水平的PCR-序列特异性寡核苷酸探针法(sequence-specific oligonucleotide, SSO)、基因芯片和高分辨水平的PCR-直接测序分型(sequence-based typing, SBT...
基于测序的分型(Sequence-based typing,SBT):该技术可在多个不同平台上进行,一种是基于Sanger的DNA测序,另一种是基于NGS的测序。该方法的最常见应用是鉴定干细胞移植受体和供体的等位基因水平上的HLA分型。等位基因一般指位于一对同源染色体的相同位置上控制着相对性状的一对基...