组织抗原分型(HLA-typing)又称为组织型监定(tissue typing)分为第一型(HLA-A, B, C)和第二型(HLA, DP, DQ, DR) 都位於人类的 … tw.myblog.yahoo.com|基于17个网页 2. 人类白血球抗原配对 ...热烈回响,尤其 我将台大肾脏移植手术中,所获得关於人类白血球抗原配对(HLA-typing)的知 识,首次介绍给...
纳昂达曾于 2019 年推出 HLAtyping Panel v1.0,以杂交捕获的方式对 HLA 基因编码区靶向测序,其特点在于:以参考基因组序列为基础设计编码区探针,再考察不同型别的序列差异,补充多态性探针,解决了 HLA 序列多态性超过单条探针容错能力的问题,实现了对所有型别编码区的有效捕获。区别于依赖 PCR 的富集方式,杂交捕获不...
HLA分型 HLA-typing 一、HLA背景介绍 HLA(Human Leukocyte Antigen,人类白细胞抗原)是人类的主要组织相容性复合体(Major Histocompatibility Complex, MHC)表达的产物,其编码的分子参与抗原递呈,制约细胞间相互识别及诱导免疫应答。 HLA位于人类6号染色体短臂一段约3.6M的参与免疫反应的多态性区域,HLA复合体可以分为...
(4)基于测序的分型方法:SBT(Sequencing-Based Typing)是用两侧引物对HLA基因多态性的区域进行PCR扩增,然后对扩增产物进行Sanger测序,获得HLA等位基因序列从而进行分型。SBT技术是目前HLA基因分型的金标准,具有分辨率高、准确性高以及特异性强的特点,但其针对HLA-I类基因的第2、3、4外显子以及HLA-II类基因第2...
HLA复合体的遗传特点 1复等位基因2共显性遗传3极高的多态性 截至2009年10月 HLAI类基因-抗原结构特点 HLAII类基因-抗原结构特点 2HLA分型技术 血清学水平 基因水平 SSP (sequencespecificprimer)SSO (sequencespecificoligonucleotide)SBT (sequence-basedtyping)HLA测序分型(SBT)的PCR策略 HLA–A、C HLA–B HLA...
当使用多态性优化设计的 HLAtyping Panel 进行双平台捕获测序时,不同分析软件下的 Call rate 均能达到 100%,36 种 HLA 标准品合计 72 个 Allele 的分型准确率也在 98.5% 以上。即使平均测序深度低至 50x 时,也依然可以达到上述指标,这表明捕获数据均一性较好,不存在因某些 HLA 基因缺失或捕获质量差,导致无法...
关键词:HLA; typing; NGS; 本文整理搜集了用于HLA typing的软件,供大家参考。 先贴一张比较全的表格: 表格来源:https://www.nature.com/articles/jhg2015102/tables/2 表格中未列出的HLA-typing软件还包括: SOAP-HLA: http://soap.genomics.org.cn/SOAP-HLA.html ...
[6]Dilthey AT, Mentzer AJ, Carapito R, et al. HLA*LA-HLA typing from linearly projected graph alignments[J]. Bioinformatics. 2019,35(21):4394-4396. [7]Nishizawa A, Kumada K, Tateno K, et al. Analysis of HLA-G...
HLA Typing PCR-SSP检测HLA-B27 一、实验目的 掌握PCR-SSP的原理,了解HLA基因分型的基本方法。二、实验原理 编码HLA的基因具有高度的多态性,每一个基因座位上有众多的复等位基因,而每一个等位基因都有其各自的DNA序列,因此可用相应的序列特异性引物(sequencespecificprimers,SSP)进行扩增。通过控制PCR反应条件...
HLA分型 HLA-typing 一、HLA背景介绍 HLA(Human Leukocyte Antigen,人类白细胞抗原)是人类的主要组织相容性复合体(Major Histocompatibility Complex, MHC)表达的产物,其编码的分子参与抗原递呈,制约细胞间相互识别及诱导免疫应答。 HLA位于人类6号染色体短臂一段约3.6M的参与免疫反应的多态性区域,HLA复合体可以分为...