目前HLA-DNA分型均以PCR技术为基础,主要包括:聚合酶链反应寡核苷酸探针杂交(PCR/SSO)、顺序特异引物聚合酶链反应技术(PCR/SSP)、限制性片段长度多态性聚合酶链反应(PCR/RFLP)、聚合酶链反应单链构象多态性(PCR/SSCP)、基于序列的HLA分型法(SBT)等,最常用的主要有三种:PCR/SSP、PCR/SSCP、PCR/SSO,...
NGS(下一代测序,Next Generation Sequencing)技术也已广泛应用于HLA分型,NGS技术是对HLA基因组全长序列进行测序,其测序的深度和广度都高于SBT法,具有通量大、速度快等优势;但由于其是短片段测序,等位基因序列无法完全拼接因而同样会产生不确定的基因型,且GC异常区域NGS测序质量较差从而会影响分型准确性。四 三...
通过同时拥有一代和二代分型法交叉验证,可以保证极高的分型检测准确率。 现提供基于NGS和SBT法的HLA分型服务。NGS法涵盖可以涵盖 HLA-A, B, C, DRB1, DQB1, DPB1, DQA1, DPA1, DRB3,4,5 等11 位点。SBT法涵盖HLA-A, B, C, DRB1, DQB1, DPB1等6位点。 SBT 法分型 – 200/位点/样本 NGS法...
PCR-SBT法HLA基因分型的临床应用 HLA分型技术常应用于器官移植和骨髓移植时供者和受者组织相容性的配型,配型的准确与否直接关系到移植的效果和患者的生存质量。常见移植前的HLA配型包括I类抗原A,B,C和II类抗原DPA1、DPB1、DQA1、DQB1、DRB1/3/4/5位点。肾移植专家共识建议...
目前在实验室中进行HLA检测主要采取PCR-SBT方法,实验流程如下:▼ PCR-SBT方法是双等位基因测序,出现模棱两可的结果是该方法固有的缺陷。模棱两可的基因型结果是指在HLA基因分型过程中,标本指定结果中存在一种以上的HLA等位基因组合方式,可以加做GSSP对模棱两可的结...
基于序列的HLA分型法(SBT),可通过对扩增后的HLA基因片段进行的核酸序列测定判断HLA型别。 除上述方法外,业已建立的HLA基因分型技术还有PCR异源二聚体电泳多态即PCR指纹图分析、虚拟DNA分析、嵌合体测定、差异显示PCR、扩增非变异突变系统或扩增阻滞突变系统(ARMS)等。
其中SBT是以Sanger测序(双脱氧链ddNTP末端终止测序法)为基础的HLA分型方法,该方法具有分辨率高,可以直接读取等位基因DNA序列,且每一个碱基的读取准确率高达99.99%,能直接发现新的等位基因等特点。是世界卫生组织(WHO)推荐的HLA分型方法的"金标准"。缺点是成本高、耗时长、通量低,由于杂合子的存在,无法分辨单元型,...
HLA分型(PCR-SBT)法软件应用介绍 内容 1、HLA知识2、HLA分型技术3、HLA测序法分型(SBT)1、HLA:人类白细胞抗原 6号染色体6P213600kb 经典HLA基因分为I类和II类基因,直接参与免疫应答调控。HLA-I类基因包括A、B、C等座位。HLA-II类基因分为DR、DQ、DP、DO等亚区。HLA复合体的遗传特点 1复等位基因2...
HLA分型(PCR-SBT)法软件应用介绍 内容 ?1、HLA知识?2、HLA分型技术?3、HLA测序法分型(SBT)1、HLA:人类白细胞抗原 6号染色体6P213600kb ?经典HLA基因分为I类和II类基因,直接参与免疫应答调控。?HLA-I类基因包括A、B、C等座位。?HLA-II类基因分为DR、DQ、DP、DO等亚区。HLA复合体的遗传特点 1复...