HIVdb - HIV药物抗性数据库(HIV Drug Resistance Database),是由斯坦福大学维护的一个用于预测HIV对抗逆转录病毒药物敏感性的数据库。WHO - 世界卫生组织(World Health Organization),是联合国下属的一个专门机构,负责全球公共卫生事务。SAS - 一种统计分析软件(Statistical Analysis System),用于数据分析和管...
URF - 独特重组形式(Unique Recombinant Form),指的是在HIV病毒基因组中发现的独特重组事件。 HIVdb - HIV药物抗性数据库(HIV Drug Resistance Database),是由斯坦福大学维护的一个用于预测HIV对抗逆转录病毒药物敏感性的数据库。 WHO - 世界卫生组织(World Health Organization),是联合国下属的一个专门机构,负责全...
HIVdb - HIV药物抗性数据库(HIV Drug Resistance Database),是由斯坦福大学维护的一个用于预测HIV对抗逆转录病毒药物敏感性的数据库。 WHO - 世界卫生组织(World Health Organization),是联合国下属的一个专门机构,负责全球公共卫生事务。 SAS - 一种统计分析软件(Statistical Analysis System),用于数据分析和管理。
1.2.3 耐药判定 将序列提交至斯坦福耐药数据库(Stanford HIV Drug Resistance Database, http://hivdb.Stanford.edu), 通过在线分析工具对耐药突变位点(drug resistance mutations, DRMs)鉴定和解释, 得到所有抗病毒治疗药物的耐药程度以及耐药突变位点情况。根据耐药评分将药物敏感性分为五个水平:敏感(0~9)、潜在耐...
Additionally, the studies utilized genotyping methods for evaluating HIVDR and employed the Stanford HIV Drug Resistance Database (http://hivdb.stanford.edu) for resistance assessment. Exclusion criteria comprised studies using data from gene banks or relying on information from medical records of ...
这样的位点可通过查阅已知数据库如斯坦福大学hiv药物抗性数据库(stanforduniversityhivdrugresistancedatabase)来鉴别,在该数据库中,例如,可找到具有特定突变病毒的序列和处理或者针对具有选择突变的隔离群的药物敏感性数据。用于测试hiv的抗药性的试验是本领域中已知的。参见dongj,us20040106136和shaferr,assayfor...
To estimate the fitness function under NFV selective pressure, clinical data was pooled from the Stanford HIV Drug Resistance Database (Kantor et al., 2001), from the University Hospitals, Leuven, Belgium, and from Hospital Egas Monis, Lisbon, Portugal, to create a treated population PT of ...
1.2.3 耐药性分析 应用美国斯坦福大学 HIV-1耐 药数据库(StanfordUniversity HIV DrugResistance Database,http://hivdb.stanford.edu),将整理好的 序列提交网 站进行耐药性分析,寻找耐药相关突变, 以及对各药物敏感性(潜在耐药,低度耐药,中度耐药 或者高度耐药)进行分 析.本研究中对出现低度及以 上水平的耐药...
36、打开hiv drug resistance database耐药分析网站(https://hivdb.stanford.edu/hivdb/by-patterns/),导入拼接序列进行耐药性分析。 37、第五方面,本技术提供了第一方面所述引物组、第二方面所述测序引物组、第三方面所述试剂盒和/或第四方面所述检测方法在检测hiv-1rna整合酶区域耐药突变中的应用。
Drug resistance mutation analysis DRM analyses in PR-RT and IN regions were performed in the Stanford HIV Drug Resistance Database (https://hivdb.stanford.edu)59 using Stanford HIVdb Program Genotypic Resistance Interpretation Algorithm (https://hivdb.stanford.edu/hivdb/by-sequences)60. Inferred...