Read所在链可以通过FALG计算,我统计之后发现只有0和16两个值(2048会被直接过滤掉),0表示'+',而16表示'-'。 HiC-Pro的输出文件*.allValidPairs read的ID read1比对的contig,对应SAM的第三列,RNAME read1比对的contig的位置,对应SAM的第四列,POS read1所在链 read2比对的contig,对应SAM的第三列,RNAME read...