利用 Hi-C 数据构建染色体指纹图谱，用于后续装配过程的验证。DNB数据分析：利用 DNB 数据进行错误矫正和...
利用Hi-C数据可以基于不同构象捕获的分辨率下进行Chromosome Territories、A/B compartment、TAD、Chromatin loop这四个不同层面的互作分析(详见图1中b、c、d),洞悉在一维线性距离很远的情况下通过多层级折叠后,在三维空间以特定结构存在的DNA互作状态,结合RNA-Seq、ChIP-Seq、全基因组重测序等技术手段深入剖析这种互作...
Hi-C模式下，纯合碱基比杂合碱基要多即为异常，则会错误判断纯合子覆盖度值。
专利权项:1.一种基于Hi-C的微生物宏基因组测序分析方法,其特征在于,包括以下步骤:对微生物DNA样本的二代宏基因组原始测序数据、二代Hi-C原始测序数据和三代宏基因组原始测序数据分别进行质控处理;对质控后的三代宏基因组测序数据进行组装,组装完成后使用质控后的二代宏基因组测序数据进行纠错,得到高质量基因组cont...
一种适用于微生物宏基因组学Hi-C高通量测序建库方法及应用 本发明涉及一种适用于微生物宏基因组学HiC高通量测序建库方法及应用,所述测序建库方法包括以下步骤:1)取宏基因组样本进行微生物与杂质分离,甲醛交联;2)细胞染色质经酶切打断获得酶切后物料;3)对所述酶切后物料进行末端补平;4)进行DNA细胞核分子内连接...
摘要: 肝细胞癌(Hepatocellularcarcinoma,HCC)的肿瘤发生是基因组突变和表观遗传修饰变化积累的结果,但是HCC发生过程中的三维基因组构造变化仍然缺乏研究.基于此,在人源HCC细胞系PLC/PRF/5和人源正常肝细胞系L02中进行了原位Hi-C分析,并辅以转录组测序以及SMC3/CTCF/H3K27ac... 查看全部>> ...
基于Hi-C测序数据,既可进行基因组辅助组装,又可对基因组序列、基因结构及其调控元件的三维空间结构互作进行差异分析,结合基因功能研究,深入解析关键科学问题。如果一次Hi-C建库测序就可以搞定辅助组装和空间构象互作分析,那还等啥? Hi-C辅助基因组组装 1
大花序桉(Eucalyptus cloeziana)是中国重要用材林树种,但目前对其生物信息学研究缓慢,在一定程度上限制了大花序桉分子育种以及品种改良.采用Illumina Hi Seq TM 2000高通量测序平台对1年生大花序桉根系转录组测序和de novo组装,将得到的Unigene与公共数据库比对,同时进行转录组分析.结果显示,组装获得53 433条Unigene,...
生物制药N/C端测序生物药糖谱检测蛋白质肽谱图测定 氢氘交换质谱HDX MS蛋白质等电点测定宿主蛋白残留(HCP)分析 生物药糖基化位点检测生物制药N端测序生物药氨基酸组成分析 单细胞分析 检测平台 检测分析平台:高分辨率质谱仪、高效液相色谱、气相色谱、NMR; ...
武汉贝纳科技申请基于Hi-C的微生物宏基因组测序分析方法和系统专利,获取高质量宏基因组组装结果,武汉,贝纳科技,微生物宏基因组