热图和注释的图例可以分别在Heatmap()函数的heatmap_legend_param参数和HeatmapAnnotation()函数的annotation_legend_param参数中进行设置 1. 连续型图例 连续型图例需要传递一个颜色映射函数,类似于热图及注释函数中的col参数,但是图例中的颜色映射函数中的break与显式的并不完全一样 例如 col_fun <- colorRamp2( ...
Heatmap(matrix(rnorm(100),10),heatmap_legend_param=list(title="rnorm",at=c(-2,0,2),labels=c("neg_two","zero","pos_two")),top_annotation=HeatmapAnnotation(foo=1:10,annotation_legend_param=list(foo=list(title="foo_top_anno"))) image 在下面的例子中,我们只展示了如何构造图例对象,而...
heatmap_legend_param = list( title = "rnorm", at = c(-2, 0, 2), labels = c("neg_two", "zero", "pos_two") ), top_annotation = HeatmapAnnotation( foo = 1:10, annotation_legend_param = list(foo = list(title = "foo_top_anno")) )) 可以自由设置图例刻度位置、标签、图例标题...
1、双侧柱状图的做法及其坐标轴的设置。 2、热图其他参数在热图系列已经出现,这里学习legend的位置设置。 复现图片 image.png 注释代码及数据已上传群文件! 这里作图数据一部分是结合原文给出的补充材料,一部分是我自己创造的。柱状图和热图是两个文件。首先完成柱状图的部分: setwd("E:/生物信息学/复现Cell双向柱状图...
show_heatmap_legend = TRUE, 是否展示图例 heatmap_legend_param = list(title = name), #heatmap_legend_param:热图图例设置(标题,位置,方向,高度等)参数列表,详情可见color_mapping_legend,ColorMapping-method。例如:heatmap_legend_param = list(title= “legend”, title_position =“topcenter”, ...
heatmap_legend_param = heatmap_legend_param) #对行显示位置进行调整 oncoPrint(mat, alter_fun = alter_fun, col = col, remove_empty_columns =TRUE, remove_empty_rows =TRUE, pct_side ="right", row_names_side ="left", column...
Heatmap(mat, name = "legend") 热图图例的标题也可以通过参数heatmap_legend_param进行更改。 Heatmap(mat, heatmap_legend_param = list(title = "legend")) 你可以设定热图的行与列标题,行与列图形参数分别通过row_title_gp和column_title_gp选项指定,使用gpar()函数进行具体的设置。
(fill = "black", col = "black")) } }, col = c("B" = "black", "W" = "white"), show_row_names = FALSE, show_column_names = FALSE, column_title = "One famous GO game", heatmap_legend_param = list(title = "Player", at = c("B", "W"), labels = c("player1", "...
# 这里用 name 为热图指定了名称,可以看到图中图例的名称改为了nameHeatmap(mat,name="mat",col=col_fun) 对于包含 NA 的矩阵,我们可用na_col设置对应颜色: 代码语言:javascript 复制 mat_with_na=matna_index=sample(c(TRUE,FALSE),nrow(mat)*ncol(mat),replace=TRUE,prob=c(1,9))mat_with_na[na_in...