组织学染色显示,所有三个HD-Zip IV基因在花柱的上部区域特异性表达,而Wo的表达高于HD7和HD7L(图3A)。支持它们在雄蕊中的功能,三个HD-Zip IV基因在花药之间的连接处高度表达,其中HD7和HD7L的表达高于Wo(图3B和图S3F)。空间和时间上的表达模式表明,Wo可能主要在花柱中发挥作用,而HD7和HD7L在花药锥形成中起...
在模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)中,存在着具有独特脂质感应能力的同源结构域亮氨酸拉链(HD-ZIP)IV转录因子家族。这些转录因子含有一个高度保守的脂质转移结构域——START域,该结构域与类固醇激素合成急性调节蛋白(StAR)具有相似性,并已被证实对HD-Zip IV转录因子的活性至关重要。然而,尽管START域的重要性已得到...
随着生命科学领域的不断发展,关于HD-Zip Ⅰ基因家族调控植物响应耐受性的生物学特征已被深入研究,但多数来自模式植物拟南芥中,重要农作物玉米、大豆和水稻等中的HD-Zip Ⅰ转录因子上下游调控机制仍不清晰,比如不同的逆境条件下的表达模式,如何参与不同的信...
(3)通过在拟南芥中异源表达LcATHB15实验,揭示了LcATHB15可以激活AtSR45的表达进而调控拟南芥种子的发育。 Fig.1 Ectopic expression of LcATHB15 in Arabidopsis causes reduced seed number意义和创新性 本研究揭示了HD-Zip转录因子LcATHB...
HD-Zip IV家族蛋白是转录调控因子,通常参与植物表皮细胞发育。在拟南芥中,表皮分化受两个HD-Zip IV基因调控,即拟南芥分生组织LAYER1 (AtML1)和原皮因子2 (PDF2)。在番茄中,AtML1和PDF2的同源物Woolly (Wo)控制叶片和茎表面毛状体的形成和分化,作为抵御食草动物的一部分。
在植物生长发育过程中,HD-Zip蛋白通常与特定顺式作用元件结合,通过影响转录过程来调控相关基因的表达,进而实现各种生物学过程。例如,在拟南芥中,HD-Zip蛋白可以与特定的顺式作用元件结合,调控叶绿体发育、维管束发育等过程。此外,HD-Zip蛋白还参与植物对环境信号的响应,如干旱、高盐等胁迫条件下的适应性反应。总之,HD...
这里我们选取的HD-ZIP III属于转录因子,则可以根据植物转录因子数据库(http://planttfdb.cbi.pku.edu.cn/)下载目标物种中的HDZIP家族的CDS及PEP序列。 ### 根据目标,下载拟南芥物种中的pep序列wget http://planttfdb.cbi.pku.edu.cn/download_seq.php?sp=Ath\&fam=HD-ZIP##下载拟南芥CDS序列wget http://...
在本研究中,我们报道了同源结构域亮氨酸拉链(HD-ZIP)IV转录因子GhHOX4在纤维伸长中起重要作用。 GhHOX4基因在棉花中的过表达导致纤维长度增加,而GhHOX4基因沉默的转基因棉花与野生型相比表现出“短纤维”表型。 GhHOX4直接激活两个靶基因GhEXLB1D和GhXTH2D,促进纤维伸长。另一方面,与细胞信号和代谢相关的磷脂酸...
【目的】鉴定辣椒HD-Zip基因家族,并利用生物信息学方法系统分析其在基因组中的分布、基因结构、进化分化特征及在不同组织中的时空表达特异性,解析该家族的进化特征及生物学功能。【方法】根据已报道及PlantTFDB数据库中的拟南芥HD-Zip序列,利用本地BLAST工具在我国辣椒测序品种‘遵辣1号’基因组中比对,并利用Pfam、SM...
鉴定出大麻HD-Zip家族分为4个亚家族:HD-ZipI家族14个,HD-Zip II家族7个,HD-Zip III家族3个,HD-Zip IV家族9个。大麻、水稻和拟南芥的协方差分析显示,大麻HD-ZIP家族与拟南芥和水稻的基因有20对同源基因,其中12对共有(图3)。不同物种的同源基因在进化过程中保持相同或相似的功能,基因的组织表达模式通常与...