1.gcc下载安装 apt-getinstall gcc 2.g++下载安装 apt-getinstall g++ 3.python Ubuntu系统自带python3.8.10,没有的可以安装一下 apt install python 4.Cmake apt-getinstall cmake 二.显卡驱动和CUDA安装 1.显卡驱动 Ubuntu20.04安装之后已经有显卡驱动,但版本较旧,需要更改。在左下角显示应用程序中 选择“软...
至此CUDA安装完成,输入nvcc -V命令查看CUDA信息 三.Gromacs-2022 GPU-CUDA安装 打开gromacs官网,下载最新版gromacs-2022 https://manual.gromacs.org/documentation/ 将tar.gz文件解压 tar xfz gromacs-2022.tar.gz 进入解压后的文件夹 cd gromacs-2022 mkdir build cd build 在build目录下用cmake进行安装 cmake ...
1)如果使用显卡做输出,则不加任何参数,直接安装 2)如果不使用显卡做输出,或者使用的是GPU卡,则需要添加--no-opengl-files参数 8、选择Yes 9、选择No 由于不使用显卡做输出,则选择No,不更新X配置 10、安装完成,选择OK 11、重启机器,测试nvidia-smi命令可以正常输出,安装完成。 根据需要安装对应的CUDA_TOOLKIT,具...
至此CUDA安装完成,输入nvcc -V命令查看CUDA信息 nvcc -V 1. 三、Gromacs-2022 GPU-CUDA安装 打开gromacs官网,下载最新版gromacs-2022 https://manual.gromacs.org/documentation/ 将tar.gz文件解压 tar xfz gromacs-2022.tar.gz 1. 进入解压后的文件夹 cd gromacs-2022 mkdir build cd build 1. 2. 3. 在b...
一. GROMACS的安装: GROMACS是免费开源的分子动力学软件,目前最新版本是2022.1。 1. 服务器选择 根据需要选择GPU服务器,在配置时选择后台安装CUDA驱动,建议选择较新版本驱动及CUDA,对GROMACS-2022而言,需要CUDA版本大于11.0。官网说明11.3可能安装有问题,未测试;已测试11.0及11.4安装GROMACS2022.1可成功。按以下操作在Ubun...
4.gromacs2021/2022的安装包 二.编译的过程 1.gromacs2021.6(GPU)在之前Visual Studio 2022的版本刚刚...
GPU=ON -DCUDA_TOOLKIT_ROOT_DIR=/usr/local/cuda选项（以实际CUDA tookit安装路径为准）。
Built on Mon_Oct_24_19:12:58_PDT_2022 Cuda compilation tools,release12.0,V12.0.76Build cuda_12.0.r12.0/compiler.31968024_0 5,安装fftw 代码语言:javascript 复制 wgethttp://www.fftw.org/fftw-3.3.10.tar.gz tar-xzvf fftw-3.3.10.tar.gz ...
二.安装gromacs2022.4 解压:tar -xzvf gromacs-2022.4.tar.gz cd gromacs-2022.4 mkdir build cd build 输入cmake .. -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/home/xjtu/gmx-2022.4 -DGMX_BUILD_OWN_FFTW=on -DGMX_MPI=off -DGMX_GPU=off make(一系列等待)
只选择安装CUDA分类里的Developent、Runtime和Visual Studio Integration就行。然后在安装好fftw之后,使用下面命令安装gromacs的GPU版本。使用Developer PowerShell for VS 2022窗口进入解压目录后,运行: mkdir buildcd buildcmake .. -DCMAKE_INSTALL_PREFIX= D:\install\gmx-2023-GPU -DGMX_FFT_LIBRARY=fftw3 -D...