GROMACS不像Amber那样自带MM/PBSA.py结合自由能计算程序【1】。2014年,Kumari等人发布第一个用于GROMACS分子动力学轨迹的MM/PBSA计算程序g_mmpbsa【2】。但该程序安装麻烦,对GROMACS版本有特定要求(非常古老的4.5/4.6/5.0/5.1),现已不再更新...
这个近期发展的gmx_MMPBSA工具令GROMACS用户可以直接利用免费的AmberTools的MMPBSA.py进行结合自由能计算 h...
GPCR的二聚体，想算两单体间的结合自由能。...可以做的。但算的也不是结合能的绝对值，是相对值，...
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这个近期发展的gmx_MMPBSA工具令GROMACS用户可以直接利用免费的AmberTools的MMPBSA.py进行结合自由能计算 h...
设置export MMPBSA=可执行程序的路径 发自小木虫Android客户端