今天我们为大家介绍另外一款非常方便的基于Gromacs模拟后产生的轨迹文件进行结合自由能计算(包括MM-PB(GB)SA方法计算结合自由能、熵计算、能量分解等)的工具--gmx_MMPBSA。 gmx_MMPBSA是基于Amber中的MMPBSA.py进行的结合自由能计算,因此需要事先安装AmberTool20或者更高版本。AmberTool20可由官方网站免费下载,大家可...