table(GPL14877$Probe.Set.Name %in% GPL570$probe_id) table(GPL14877$Probe.Set.Name %in% ids$probe_id) table(GPL570$probe_id %in% ids$probe_id) 真的非常的意外啊!!! GPL14877 与 GPL570 不一样 ? 我再次看: This arrayis identical to GPL570but the data were analyzed with a custom CDF B...
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在GEO网站上,查找数据集 拉到页面下方,下载矩阵和raw data。 下载好后,将文件拷贝到Rproject文件夹中。 点开这个数据集中的任意一个样本。 阅读作者是如何标准化表达谱的。 作者使用的是gcRMA标准化算法,我们…
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GPL15308 事实上,这个平台应该是GPL570,但是被CCLE数据库给稍微变通了一下,就给了一个GPL15308的标签,平台主页也写的很清楚,它的探针ID是伪ID,其实就是entrez gene ID 本来这个芯片设计的是五万多个探针,最后只剩下了18926个基因 This array is identica...
TNBC数据分析中GSE76275数据集的主要特征是什么? GSE76275数据集在TNBC研究中如何应用? GPL570平台在TNBC数据分析中的作用是什么? 五月份的学徒专注于GEO数据库里面的表达量芯片数据处理,主要的难点是表达量矩阵获取和探针的基因名字转换,合理的分组后就是标准的差异分析,富集分析。主要是参考我八年前的笔记: 解读GEO...
软件名称GPL570芯片分析软件 软件简称DHV版本号V1.0 登记号2015SR100916分类号- 著作权人天津脉络生物科技有限公司首次发表日期- 登记日期2015-06-08 该公司其他软件著作权 序号登记日期软件全称软件简称登记号版本号 12024-12-03新冠检测预约系统-2024SR1959234V1.1.6 ...
TNBC数据分析-GSE76275-GPL570主要是获取分组信息和判断表达矩阵是否需要log在读取pd进行样本分组时发现利用pd任何一列都无法正确区分tnbc和nontnbc得到文献中给出的分组样本数但是geo提供了两种样本的分开版本所以分别处理gse76275的两个子数据集 TNBC数据分析-GSE76275-GPL570 五月份的学徒专注于GEO数据库里面的表达量...
To prevent this, the GPL assures that patents cannot be used to render the program non-free.The precise terms and conditions for copying, distribution and modification follow.TERMS AND CONDITIONS0. Definitions."This License" refers to version 3 of the GNU General Public License....
Cutting machine Platform for dry transfer of 2D materials < 1 2 > Address: 77 Yingkou Road, Changchun 130033, Jilin, China. Tel: +86-431-86708306 Fax: +86-431-86708300 E-mail: wentingsun@ciomp.ac.cn Copyright©The GPL Photonics Laboratory 吉ICP备11002662号-18 ...
芯片平台:[GPL570] (https://www.ncbi.nlm./geo/query/acc.cgi?acc=GPL570), [HG-U133_Plus_2] Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array] 样品列表: 如下,样本太多并未一一列出,详见链接。GSM1300062 102TGSM1300063 103NGSM1300064 104TGSM1300065 105NGSM1300066 106TGSM1300067 107NGSM13000...