在GO富集分析中,BP代表生物过程(Biological Process),CC代表细胞组分(Cellular Component),MF代表分子功能(Molecular Function)。 GO富集分析的基本概念 GO(Gene Ontology)富集分析是一种生物信息学分析方法,用于确定给定基因集中的功能富集或富集的生物学过程。GO富集分析通过检查...
一、BP、CC、MF在GO富集分析中的含义 生物过程(BP): 描述生物学上发生的一系列事件,如细胞生长、代谢过程、信号传导、细胞周期、细胞死亡、免疫反应等。 在GO富集分析中,BP通常用来描述与疾病或实验条件相关联的基因或蛋白质在哪些生物过程中发挥作用。 细胞组分(CC): 描述基因产物在细胞内的位置,如细胞核、...
☞零代码GO富集分析—柱形图同时展示BP,MF,CC,KEGG 可能有小伙伴会说,有些文章里面用到的是下面这种展示方法,BP,CC和MF在同一张图里面展示,分别用不同的颜色来区分。其实如果仔细看过小编前几期视频内容的小伙伴,应该能自己做出这张图来。如果搞不定的,可以参考文末视频。 零代码GO富集分析—一张图展示BP...
通常我们在进行GO功能富集分析时,会在结果中标注GO所属分类:BP、CC、MF。然而,某些在线网站,例如KOBAS出来的结果是没有这个分类信息的。 结果少的话,我们可以去gene ontology官网一个一个查询,但是当我们有很多ID时,就需要用程序来解决了。 基于用户的反馈,微生信平台上线了一个小工具:批量将GOID转成GO term并...
GO富集分析是生信文章中常用的一种技术。它可以对基因和基因产物按照其参与的BP(Biological Process,生物过程)、MF(Molecular Function,分子功能)、CC(Cellular Component,细胞组分)三个方面进行分类注释,大致了解某个物种的全部基因产物的功能分类情况,对基因进行注释和分类,将发生差异的基因富...
基因本体论(Gene Ontology,GO)计划(http://www.geneontology.org)为注释基因、基因产物和序列开发了一套结构化的、受控词汇表。它被分成三部分:分子功能(Molecular Function,MF)、生物过程(Biological Process,BP)和细胞组分(Cell Component,CC)。 GO功能富集分析结果,一般都会包含至少4列:GO term,基因数,P值和类...
BP指生物过程，描述基因或蛋白质参与的生物学活动，如细胞代谢、信号传导等。CC指细胞组成，用于描述基因或蛋白质所在位置和结构，如核内、线粒体等。MF指分子功能，表示基因或蛋白质具有的化学活性或能力，例如酶催化反应、DNA结合能力。这些术语来自GO框架，在研究中帮助科学家对功能进行注释与分类，并...
实现R语言GO分析bp mf cc三合一双侧条形图 摘要 在本文中,我将指导一名刚入行的小白如何使用R语言实现GO分析中的bp(生物过程)、mf(分子功能)和cc(细胞组件)三合一双侧条形图。我将逐步介绍整个流程并提供相应的代码示例,帮助小白顺利完成任务。 流程图 ...
数据集数据集GSE35257和GSE121190中具有下调功能的差异表达基因 实验组和正常组差异表达基因的火山图 GO分析的BP、CC、MF三合一条形图 肾纤维化中差异表达基因的富集点气泡 肾纤维化中的差异表达基因的水平条形图 差异表达基因建立的PPI网络图 10个中心基因的相互作用图 相关文章1...