1. BP（Biological Process）代表生物过程，涉及基因或蛋白质参与的生物学活动，例如细胞代谢、信号传导等。2. CC（Cellular Component）指的是细胞组成，描述基因或蛋白质在细胞中的位置和结构，例如核内、线粒体等。3. MF（Molecular Function）指的是分子功能，表示基因或蛋白质所
一、BP、CC、MF在GO富集分析中的含义 生物过程(BP): 描述生物学上发生的一系列事件,如细胞生长、代谢过程、信号传导、细胞周期、细胞死亡、免疫反应等。 在GO富集分析中,BP通常用来描述与疾病或实验条件相关联的基因或蛋白质在哪些生物过程中发挥作用。 细胞组分(CC): 描述基因产物在细胞内的位置,如细胞核、...
BP（BiologicalProcess）、CC（CellularComponent）和MF（MolecularFunction）是基因功能分类的重要概念。BP指生物过程，描述基因或蛋白质参与的生物学活动，如细胞代谢、信号传导等。CC指细胞组成，用于描述基因或蛋白质所在位置和结构，如核内、线粒体等。MF指分子功能，表示基因或蛋白质具有的化学活性或能力...
基因本体论(Gene Ontology,GO)计划(http://www.geneontology.org)为注释基因、基因产物和序列开发了一套结构化的、受控词汇表。它被分成三部分:分子功能(Molecular Function,MF)、生物过程(Biological Process,BP)和细胞组分(Cell Component,CC)。 GO功能富集分析结果,一般都会包含至少4列:GOterm,基因数,P值和类别。
GO富集分析是生信文章中常用的一种技术。它可以对基因和基因产物按照其参与的BP(Biological Process,生物过程)、MF(Molecular Function,分子功能)、CC(Cellular Component,细胞组分)三个方面进行分类注释,大致了解某个物种的全部基因产物的功能分类情况,对基因进行注释和分类,将发生差异的基因富...
GO，一个对基因、产物和序列进行结构化描述的工具，划分为MF（分子功能）、BP（生物过程）和CC（细胞组分）三个维度。对于其富集分析结果，通常包含GO术语、基因数量、P值和类别等信息。要创建可视化图，首先，打开一个专门的绘图页面，如bioinformatics.com.cn/p...，页面左侧有导航，中间是输入框和可...
通常我们在进行GO功能富集分析时,会在结果中标注GO所属分类:BP、CC、MF。然而,某些在线网站,例如KOBAS出来的结果是没有这个分类信息的。 结果少的话,我们可以去gene ontology官网一个一个查询,但是当我们有很多ID时,就需要用程序来解决了。 基于用户的反馈,微生信平台上线了一个小工具:批量将GOID转成GO term并...
1.基因富集工具DAVID介绍(一)-基因ID转换 | 2.基因富集工具DAVID介绍(二)-KEGG富集分析 | 3.基因富集工具DAVID介绍(三)-零代码展示KEGG富集结果 | 4.基因富集工具DAVID介绍(四)-GO富集分析及柱形图展示 | 5.GO和KEGG富集分析视频讲解 | 6.KEGG富集分析—柱形图,气
基于DAVID富集分析结果,零代码在一张图里面用柱状图展示GO的BP,MF和CC的富集结果, 视频播放量 1748、弹幕量 0、点赞数 20、投硬币枚数 0、收藏人数 40、转发人数 4, 视频作者 生信交流平台, 作者简介 生信博士,分享生信技能。合作请联系:,相关视频:9.1 GO,KEGG富集分
在GO富集分析中，我们同样使用DAVID工具，将基因集合按照生物过程（BP）、分子功能（MF）和细胞成分（CC）三个维度进行富集分析，并通过柱形图展示结果。这样，科研新手也能轻松地获得发表级的GO富集分析图。为满足更多展示需求，本篇内容还介绍了零代码GO富集分析，将BP、MF、CC和KEGG富集结果整合在一张...