GO(Gene Ontology)富集分析是一种生物信息学分析方法,用于确定给定基因集中的功能富集或富集的生物学过程。GO富集分析主要涉及三个分支:生物过程(Biological Process,BP)、细胞组分(Cellular Component,CC)和分子功能(Molecular Function,MF)。下面将详细解释这三个分支在GO富集分析中的含义、应用方法,并提供相关的分析步...
5.零代码GO富集分析—柱形图同时展示BP,MF,CC,KEGG 你看下面这篇文章,发表在scientific reports上。虽然被称为四大水刊之一,但是也毫不影响人家的影响因子上4.380。 下面就是这篇文章中的GO和KEGG富集分析图,眼尖的小伙伴应该一眼就能看出是用Excel画出来的。 上面这张figure分了四张柱形图来分别展示BP,CC,MF和...
基因本体论(Gene Ontology,GO)计划(http://www.geneontology.org)为注释基因、基因产物和序列开发了一套结构化的、受控词汇表。它被分成三部分:分子功能(Molecular Function,MF)、生物过程(Biological Process,BP)和细胞组分(Cell Component,CC)。 GO功能富集分析结果,一般都会包含至少4列:GO term,基因数,P值和类别。
GO富集分析是生信文章中常用的一种技术。它可以对基因和基因产物按照其参与的BP(Biological Process,生物过程)、MF(Molecular Function,分子功能)、CC(Cellular Component,细胞组分)三个方面进行分类注释,大致了解某个物种的全部基因产物的功能分类情况,对基因进行注释和分类,将发生差异的基因富...
在GO富集分析中，我们同样使用DAVID工具，将基因集合按照生物过程（BP）、分子功能（MF）和细胞成分（CC）三个维度进行富集分析，并通过柱形图展示结果。这样，科研新手也能轻松地获得发表级的GO富集分析图。为满足更多展示需求，本篇内容还介绍了零代码GO富集分析，将BP、MF、CC和KEGG富集结果整合在一张...
1.基因富集工具DAVID介绍(一)-基因ID转换 | 2.基因富集工具DAVID介绍(二)-KEGG富集分析 | 3.基因富集工具DAVID介绍(三)-零代码展示KEGG富集结果 | 4.基因富集工具DAVID介绍(四)-GO富集分析及柱形图展示 | 5.GO和KEGG富集分析视频讲解 | 6.KEGG富集分析—柱形图,气
更新快:每月更新一次,保证了数据的可靠性;覆盖广:整合了GO、KEGG、Uniprot等多个权威的功能数据库;同时Metasacape不仅可以分析人类(H. sapien)的数据,还包括很多其他物种数据,如 M. musculus, R. norvegicus, D. rerio, D. melanogaster, C. elegans, S. cerevisia
基因富集工具DAVID介绍(二)-KEGG富集分析 3.基因富集工具DAVID介绍(三)-零代码展示KEGG富集结果 4.基因富集工具DAVID介绍(四)-GO富集分析及柱形图展示 5.GO和KEGG富集分析视频讲解 6.KEGG富集分析—柱形图,气泡图,通路图 7.GO和KEGG富集结果如何显示基因symbol 8.GO和KEGG富集倍数(Fold Enrichment)如何计算...
其中横坐标代表生物学功能,纵坐标代表富集分析得分数值;2B.下调差异基因的BP、CC和MF三合一条形图的GO功能富集图,其中横坐标代表生物学功能,纵坐标代表富集分析得分数值;2C.上调DEG的富集气泡图,其中横坐标代表富集分析得分,纵坐标代表信号通路分类;2D.下调DEG的富集气泡图,其中横坐标代表富集分析得分,纵坐标代表信号...
5.零代码GO富集分析—柱形图同时展示BP,MF,CC,KEGG 你看下面这篇文章,发表在scientific reports上。虽然被称为四大水刊之一,但是也毫不影响人家的影响因子上4.380。 下面就是这篇文章中的GO和KEGG富集分析图,眼尖的小伙伴应该一眼就能看出是用Excel画出来的。