在有了dppc的小盒子之后,我们只需要在X和Z方向上对小盒子进行平铺就可以得到一个简单的脂单层了。 gmx genconf -f dppc_box.gro -nbox 11 1 15 -o mem_up.gro 假设我们需要一个X和Z方向尺寸都为8 nm左右的脂双层,则根据上一小节末尾的dppc小盒子的尺寸,计算在X和Z方向上各应该平铺多少个小盒子。-nbox...
gmx genconf -f *.pdb -o min.gro gmx grompp -f mini.mdp -c min.gro -p sys.top -o em...
>> rotation... And have a good look at what you're actually trying now by >> taking the rotated system and stack it a few times using genconf -nbox 2 2 2 >> >> Cheers, >> >> Tsjerk >> >> On Jan 6, 2011 7:22 PM, "mohsen ramezanpour" >> <ramezanpour.moh...@gmail.c...
onclick='gentop()' style='width:100%; height:30px'>
gmx_incons("Not supported in write_sto_conf_indexed"); } } 开发者ID:dkarkoulis,项目名称:gromacs,代码行数:59,代码来源:confio.c 示例2: get_stx_coordnum ▲点赞 6▼ voidget_stx_coordnum(constchar*infile,int*natoms){ FILE *in;intftp, tpxver, tpxgen; ...