使用repel包:repel包是ggplot2的一个扩展包,它提供了一些方法来自动调整标签位置,避免重叠。可以使用geom_text_repel函数替代geom_text函数,它会自动调整标签位置,使它们不会重叠。 使用ggrepel包:ggrepel包也是ggplot2的一个扩展包,它提供了更高级的标签排列和调整功能。可以使用geom_text_repel函数替代geom_te...
geom_text(aes(label = am)) 在geom_text中,我们提供了aes(label = am),它描述了所有点应显示“am”的相应级别。 在图中可以看出’am’的标签与点重叠。 在某些情况下,当点数很多时可能难以阅读标签。 为了避免这种情况,我们在’ggrepel’包中使用geom_text_repel函数。 if(!require(ggrepel)) { install....
这两个函数通常与其他ggplot2函数一起使用,例如geom_point、geom_text等。它们可以用来微调散点图中点的位置,或者在柱状图中微调标签的位置,以便更好地展示数据。 ggplot2是一个用于数据可视化的R语言包,它提供了一套灵活且强大的绘图语法。通过ggplot2,用户可以轻松创建各种类型的统计图表,包括散点图、柱状图、折线...
ggplot2绘图系统——扩展包ggrepel、ggsci、gganimate、ggpubr等 部分扩展包可在CRAN直接下载,有些需借助devtools包从Github下载。 1. ggrepel包 用来在图上添加文字和标签,相比geom_text和geom_label函数,能将重叠的标签分开,并添加指示短横线。 library(ggrepel) ggplot(mtcars,aes(wt,mpg))+geom_point(color='...
p+ggrepel::geom_text_repel( aes(label=gene,color=cd),df2, size = 4, #注释文本的字体大小 box.padding = 0.5, #字到点的距离 point.padding = 0.8, #字到点的距离,点周围的空白宽度 min.segment.length = 0.5, #短线段可以省略 segment.color = "black", #segment.colour = NA, 不显示线段 ...
ggplot2绘图系统——扩展包ggrepel、ggsci、gganimate、ggpubr等 部分扩展包可在CRAN直接下载,有些需借助devtools包从Github下载。 1. ggrepel包 用来在图上添加文字和标签,相比geom_text和geom_label函数,能将重叠的标签分开,并添加指示短横线。 library(ggrepel) ...
geom_text_repel(data = filter(data, gene %in% core_gene), max.overlaps = getOption("ggrepel.max.overlaps", default = 20), # 这里的filter很关键,筛选你想要标记的基因 aes(label = gene), size = 2, color = 'black') + xlab("Log2FC")+ ...
这里我们新增sign列，利用ifelse函数添加重点显著差异基因，然后使用geom_text参数添加到图上 然后绘制图片...
geom_text_repel( data = subset(hs_data, hs_data$Pvalue < 0.000001 & abs(hs_data$log2FC) >= 3), aes(label = ID), size = 3, box.padding = unit(0.5, "lines"), point.padding = unit(0.8, "lines"), segment.color = "black", show.legend = FALSE ) ...
使用ggrepel中的geom_text_repel函数来给数据点添加数字标签,需要指定数据来源(哪个表、哪一列); 6.提升 初学者对ggplot的具体函数了解不深,难以细致的修饰图形,ggthemeassist包提供了手动解决方案。选中ggplot代码,点击Addins(Rstudio中),即可弹出手动编辑框,像操作Excel绘图一样通过鼠标来修订图形。修订完成后,Rstu...