2load(file = "F:/Bioinfor_project/Breast/AS_research/AS/result/hubgene.Rdata") 3head(data) 4require(cowplot) 5require(tidyverse) 6require(ggplot2) 7require(ggsci) 8require(ggpubr) 9mydata<-data %>% 10 ## 基因表达数据gather,gather的范围应调整11 gather(key="gene",value="Expression"...
ggpubr-专为学术绘图而生(二) ggstatsplot-专为学术绘图而生(一) 生存曲线 R语言GEO数据挖掘01-数据下载及提取表达矩阵 R语言GEO数据挖掘02-解决GEO数据中的多个探针对应一个基因 R语言GEO数据挖掘03-limma分析差异基因 R语言GEO数据挖掘04-功能富集分析 如果没有时间精力学习代码,推荐了解:零代码数据挖掘课程 广...
#ggboxplot函数做图:误差线、p值、分组 colnames(box_1)[1]<-"Group" var<-colnames(box_1)[2:4] for (i in var) { my_comparisons <- list( c("MALE", "Normal"), c("FEMALE", "Normal")) p <- ggboxplot(box_1, x = "Group", y = i, color = "Group", fill = "Group", ...
加载R包 library(tidyverse) library(ggsci) 导入数据 df <- read_tsv("data.txt") 数据可视化 ...
function, ggplot2 theme name. Default value is theme_pubr(). Allowed values include ggplot2 official themes: theme_gray(), theme_bw(), theme_minimal(), theme_classic(), theme_void(), ... ... other arguments to be passed togeom_boxplot,ggparandfacet. Details...
bgcolor.R border.R compare_means.R create_aes.R desc_statby.R diff_express.R facet.R font.R gene_citation.R gene_expression.R geom_bracket.R geom_exec.R geom_pwc.R get_breaks.R get_coord.R get_legend.R get_palette.R ggadd.R ...
ggboxplot是一个R语言的数据可视化包,用于绘制箱线图(boxplot)。在数据分析和统计学中,箱线图可以展示一组数据的分布特征,包括中位数、上下四分位数、最大最小值等。 NA是缺失值(Missing Value)的表示符号,表示数据中某些观测值的缺失或无效。在数据处理和分析过程中,我们需要对缺失值进行处理,以保证分析结果的...
把对应的值放到另一个字段中。宽变长的方法很多，既然题主使用的是ggpubr包，那人我就用tidyr包的...
# type ENSG00000000460# TCGA.BR.8364.01A.11R.2343.13 Tumor 8.201607# TCGA.CG.5722.11A.02R.1602.13 Normal 7.855598# TCGA.VQ.A8DU.01A.11R.A36D.31 Tumor 9.160752# TCGA.D7.A4Z0.01A.22R.A251.31 Tumor 8.260068# TCGA.B7.5818.01A.11R.1602.13 Tumor 8.456898# TCGA.EQ.8122.01A.11R.2343.13 ...
R print(names(b)) 检查列"xcell"、"expression"和"group"的数据类型和内容是否适合ggboxplot函数的要求: x和fill参数通常应该是因子(factor)或字符型(character),而y应该是数值型(numeric)。使用str(b)可以查看数据框的结构和类型。 检查代码: R str(b) 如果类型不匹配,可以使用as.factor()或as.character...