ggboxplot是一个R语言的数据可视化包,用于绘制箱线图(boxplot)。在数据分析和统计学中,箱线图可以展示一组数据的分布特征,包括中位数、上下四分位数、最大最小值等。 NA是缺失值(Missing Value)的表示符号,表示数据中某些观测值的缺失或无效。在数据处理和分析过程中,我们需要对缺失值进行处理,以保证分析结果的...
ggpubr-专为学术绘图而生(二) ggstatsplot-专为学术绘图而生(一) 生存曲线 R语言GEO数据挖掘01-数据下载及提取表达矩阵 R语言GEO数据挖掘02-解决GEO数据中的多个探针对应一个基因 R语言GEO数据挖掘03-limma分析差异基因 R语言GEO数据挖掘04-功能富集分析 如果没有时间精力学习代码,推荐了解:零代码数据挖掘课程 广...
加载R包 library(tidyverse) library(ggsci) 导入数据 df <- read_tsv("data.txt") 数据可视化 ...
在R语言的ggplot2包中,绘制箱线图时可以通过多种方式来设置颜色。以下是一些关键点和示例代码,帮助你理解如何在ggboxplot中设置颜色: 使用aes()映射颜色: 在ggplot()函数的aes()映射中,你可以使用fill参数来指定箱线图的填充颜色。颜色将根据分组变量自动变化。 r library(ggplot2) ggplot(data, aes(x = group...
把对应的值放到另一个字段中。宽变长的方法很多，既然题主使用的是ggpubr包，那人我就用tidyr包的...
2load(file = "F:/Bioinfor_project/Breast/AS_research/AS/result/hubgene.Rdata") 3head(data) 4require(cowplot) 5require(tidyverse) 6require(ggplot2) 7require(ggsci) 8require(ggpubr) 9mydata<-data %>% 10 ## 基因表达数据gather,gather的范围应调整11 gather(key="gene",value="Expression"...
2load(file = "F:/Bioinfor_project/Breast/AS_research/AS/result/hubgene.Rdata") 3head(data) 4require(cowplot) 5require(tidyverse) 6require(ggplot2) 7require(ggsci) 8require(ggpubr) 9mydata<-data %>% 10 ## 基因表达数据gather,gather的范围应调整11 gather(key="gene",value="Expression"...
接下来,我们将展示如何使用ggboxplot()和ggpubr绘制箱线图并更改顺序。 ggboxplot 函数 使用ggboxplot()绘制箱线图时,我们可以使用x和y参数来指定 x 轴和 y 轴的列。 ggboxplot(data=ToothGrowth,x="supp",y="len") 更改顺序 方法一 我们可以使用reorder()函数,该函数会根据我们指定的列重新排序数据集。
【R语言绘图】差异表达箱线图(含显著性计算) https://mp.weixin.qq.com/s/tO6ko0c7P56k5BARjDejIQ 成果如下: 绘制该图的语法代码以及详细注释语句(比参考资料中的代码更少,更容易操作理解),我都放到【陪伴统计】社群了,自己搞不定,没时间没精力学习的朋友,欢迎付费加入社群获得该代码,有疑惑疑问及时微信讨论...
1p <- ggboxplot(mydata, x = "group", y = "Expression",2 color = "group", palette = "jama",3 add = "jitter")4# Add p-value5p + stat_compare_means() image.png 改变统计方法1# Change method2p + stat_compare_means(method = "t.test") image.png 统计学意义标注 label="p....