GFF Tools: working the Gene-Finding FormatHolmes, I
gffspan.pl gffsubtract.pl gfftransform.pl hmm2gff.pl hmmsearch2gff.pl intersectlookup.pl quickblastexblx.pl spcwise2gff.pl tandem2gff.pl transposon.modelBreadcrumbs gfftools / gene.model Latest commit ihh First commit, moving to git from CVS 6bde56e· Aug 25, 2011 HistoryHistory Breadcrumbs...
pip install git+https://github.com/altairwei/PyGFF.git How to use gfftools gfftoolscontains a series of subcommands, includesstats,conv,filterandseq. Filter GFF features with given conditions Match specified fields We can specify multiple fields of the same type, and as long as the feature ...
首先,确保你已经正确安装了bedtools,并且了解其基本用法。接着,准备两个需要求交集的GFF文件。这里,我们将假设这两个文件分别命名为fileA.gff和fileB.gff。 步骤1: 使用bedtools的intersect命令 bedtools的intersect命令是用于寻找两个或多个基因组区域文件(如BED、GFF、VCF等)之间重叠区域的工具。虽然GFF文件包含比...
#对基因组中的重复区域屏蔽 bedtools maskfasta -fi ../contig.fa -bed contig.full_mask.complex.gff -fo contig.hardmasked.fabedtools maskfasta -soft -fi ../contig.fa -bed contig.full_mask.complex.gff -fo contig.softmasked.fa发表于 2022-12-07 10:13 阅读( 2667 ) 分类:基因组学 ...
A small Chrome extension for Octopus Deploy to provide some additional functions to the user interface.Features * Dashboard project...
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TOOLS 随笔分类 -TOOLS VNC 摘要:VNC Linux 远程桌面控制软件 简介: VNC (Virtual Network Computer)是虚拟网络计算机的缩写。VNC 是一款优秀的远程控制工具软件,VNC 是在基于 UNIX 和 Linux 操作系统的免费的开源软件,远程控制能力强大,高效实用,其性能可以和 Windows 和阅读全文...
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