第一种方法是通过NCBI GEO DataSets 数据库下载,可以直接输入想查询的疾病名称就可以进行搜索获得相应的数据,网址为:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gds/?term=GSE70494 第二种方法是通过以发表的文献来查询相关疾病的GEO ID,小果是通过PubMed来查询,只需要输入相关疾病关键字和GEO就可以搜索到相关文章和GEO ID,...
GEO数据库简介,数据检索下载及其在线分析工具介绍直播结束! 聊天室 直播回放 介绍 标签 3 个回放视频 GEO数据库简介,数据检索下载及其在线分析工具介绍 46分钟 676播放 肿瘤标志物的系统综述与meta分析 42分钟 484播放 CAR-T细胞的靶点挖掘与产业化 38分钟 447播放服务器开小差了呢,请稍后再试~...
二、下载GEO数据 1. 用GEOquery包下载 #安装并加载GEOquery包***BiocManager::install('devtools')***library(GEOquery)***#在平台找好数据库,找到GSE编号,destdir设置当前目录,getGPL 和AnnotGPL都设置TRUE,可以下载和获得平台的注释文件***gse=getGEO("GSE29250",GSEMatrix=TRUE,destdir=".",getGPL=T,Anno...
彩蛋:GEO芯片数据下载及KEGG调控网络分析(下) 收藏 下载 分享 手机看 0播放 选集(0) 自动播放 登录后可发评论 评论沙发是我的～ 零基础入门信号通路必学数据库KEGG 集数:6 相关推荐 00:18 振华风光:已有多款存储器芯片提交客... 1441播放 00:13 长光华芯:公司100GEML光通信... 1150播放 00:...
第二部分,使用R的shiny工具,零代码做TCGA数据差异表达分析 1.第一期,TCGA表达谱数据和样本类型文件准备。介绍DEApp工具。 2.第二期,讲解如何在DEApp工具中进行数据上传,表达谱归一化,PCA分析,基因过滤,差异表达分析,火山图,结果下载。 3.第三期,讲解DEApp中三种做差异表达分析的方法,limma,edgeR和DEseq2,结果...
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