GEO全称Gene Expression Omnibus data base,由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库(通过NCBI首页,All Databases下拉框中选择GEO DataSets)。收录了世界各国研究机构提交的高通量基因表达数据。2000年开始建立的时候,主要是表达芯片数据(如其名),但是之后随着数据库的流行,逐渐扩展业务到许多其它的高通量...
GEO(Gene Expression Omnibus database)是NCBI负责维护的一个数据库,存储了大量高通量基因测序数据,以及其他如:甲基化、LncRNA、miRNA、拷贝数变异(CNV)等各种芯片数据。GEO数据库为研究人员提供了一个平台,用于存储、检索和分析这些数据,以促进科学发现和数据共享。 那么对于从事生信的学生或工作者,该如何从GEO上下载...
^DATABASE=GeoMiame!Database_name=Gene ExpressionOmnibus(GEO)!Database_institute=NCBINLMNIH!Database_web_link=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo!Database_email=geo@ncbi.nlm.nih.gov^PLATFORM=GPL20814!Platform_title=Human miRNA Array miRbase release19!Platform_geo_accession=GPL20814!Platform_status=...
“癌症基因组图谱”(TCGA)是由美国国家癌症研究所和国家人类基因组研究所2005年共同发起的癌症基因组计划,目前已经成为全世界最大的癌症基因数据库之一。 GEO数据库全称Gene Expression Omnibus database,是由美国国立生物技术信息中心NCBI...
GEO全称Gene Expression Omnibus data base,由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库(通过NCBI首页,All Databases下拉框中选择GEO DataSets)。收录了世界各国研究机构提交的高通量基因表达数据。2000年开始建立的时候,主要是表达芯片数据(如其名),但是之后随着数据库的流行,逐渐扩展业务到许多其它的高通量...
GEO，全称为Gene Expression Omnibus data base，由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库。该数据库收录了世界各国研究机构提交的高通量基因表达数据，包括但不限于表达芯片数据、甲基化数据、染色质结构数据和基因组-蛋白交互作用数据。GEO数据库的记录方式不仅包括原始数据、处理过的数据和...
后者GEO数据库全称Gene Expression Omnibus database,是由美国NCBI创建并维护的基因表达数据库。它创建于2000年,论文中涉及到的基因表达检测的数据几乎都提交到了这个数据库。 GEO除了二代测序数据,还包含芯片测序、单细胞测序数据,样本数据也不限于肿瘤。不同于TCGA的规整数据,GEO芯片数据由于芯片平台(公司)不同,需要...
Gene Expression Omnibus database(GEO)是由NCBI负责维护的一个数据库,设计初衷是为了收集整理各种表达芯片,但是后来也加入了甲基化芯片,甚至高通量测序数据! GEO数据库包含下面四种信息 GEO Platform (GPL)芯片平台 GEO Sample (GSM)样本ID号 GEO Series (GSE) study的ID号 ...
👉GEO数据库全称:Gene Expression Omnibus database,是由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库。它创建于2000年,收录了世界各国研究机构提交的高通量基因表达数据,基因芯片表达数据等等,论文中涉及到的基因表达检测的数据几乎都提交到了这个数据库。
Database_name = Gene Expression Omnibus (GEO)!Database_institute = NCBI NLM NIH!Database_web_link = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo!Database_email = geo@ncbi.nlm.nih.gov^PLATFORM = GPL20814!Platform_title = Human miRNA Array miRbase release 19!Platform_geo_accession = GPL20814!