GBS-SNP-CROP(GBSSNPCallingReferenceOptionalPipeline)即:基于简化基因组测序的一个分析SNP的流程(其中参考序列是可选择的,即可以不用参考序列,流程会建立一个Mock Reference)该流程可以最大程度地利用GBS数据并在没有参考Reference的情况下执行SNP基因分型分析。 GBS-SNP-CROP用7个perl脚本建立了整个分析流程。其中用...
GBS-SNP-CROP 简化基因组GBS分析流程:GBS-SNP-CROP 2021/1/12 13 评论 简化基因组测序(Reduced-Representation Ge…© 2025 Omics – Hunter 浙公网安备 33010802011761号 陕ICP备19016588号-1 邮箱:chenhao__@__evvail.com(发件请删除下划线) 站点地图 | RSS订阅 | 关于我 | 文章总览 | 友链:BioArt | ...
在GBS SNPÇ阿灵- [R eferenceöptional P ipeline(GBS-SNP-CROP)经由的顺序的顺序执行集成了定制解析和过滤用公知的,核实生物信息学工具程序,给用户完全访问所有中间文件。 通过采用基于个体内到跨种群多态性模式对应关系的变体(SNP和插入缺失)调用的新策略,该流水线能够从测序和PCR错误中识别和区分高可信变体...
GBSGBS-SNP-CROPSNP genotypingOrphan cropsPlant genetic resourcesCore collectionsWith its simple library preparation and robust approach to genome reduction, genotyping-by-sequencing (GBS) is a flexible and cost-effective strategy for SNP discovery and genotyping, provided an appropriate reference genome ...