2024-07-26 本文以1,3-丁二烯的顺反构象异构体转化为例详解了:(1) 如何用TS、QST2和QST3三种方法搜索 过渡态(Transition State,TS)结构。(2) 如何确认过渡态结构。(3) 如何构建反应路径以及计算反应能垒等。1 …
天玑算丨第一性原理:Forcite模块进行分子动力学模拟研究(DFT+Ms) 660 0 19:42 App 天玑算 | 第一性原理:Gaussian结合Multiwfn计算分析结构性质03静电势(ESP)分析(DFT+Gaussian) 410 0 16:51 App 天玑算 | 第一性原理:Gaussian结合Multiwfn计算分析结构性质-3紫外-可见吸收光谱(UV-vis)分析 845 0 16:21...
得到http://JZ4.com后修改文件后缀名为JZ4.gjf,获得Gaussian的输入文件,修改gjf文件选择并补充合适的核数、检查点文件、泛函和基组等关键词在gjf文件的开头,以及在坐标后面输入两个文件名JZ4_ini.gesp和JZ4.gesp,(前者为初始结构的RESP电荷,后者为优化后的RESP电荷),修改后文件内容如下: 使用Gaussian16优化结构 ...
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用Gaussian 16计算振动分辨的紫外-可见吸收光谱 一、Frank-Condon原理 分子在电子态之间的跃迁是极其快速的过程(飞秒量级),比分子的振动周期(皮秒量级)快得多。因此,在电子态跃迁的瞬间,分子中原子核的运动可认为跟不上电子态的变化,分子的核间距保持不变,体现在势能面上就是垂直跃迁,如下图所示,这称为Frank-...
使用命令source ~/.bashrc重新进入终端后即可使用Gaussian16. 使用g16<xxx.gjf>xxx.out命令调用Gaussian16 使用Gaussian16优化结构并计算esp电荷 分子结构获取 本教程以JZ4为例,从Pubchem上获取JZ4的3D结构SDF文件。 文件处理 对SDF文件进行处理以获得 Gaussian 可识别的文件格式JZ4.com,可使用软件Avogadro生成, ...
使用命令source ~/.bashrc重新进入终端后即可使用Gaussian16. 使用g16<xxx.gjf>xxx.out命令调用Gaussian16 使用Gaussian16优化结构并计算esp电荷 分子结构获取 本教程以JZ4为例,从Pubchem上获取JZ4的3D结构SDF文件。 文件处理 对SDF文件进行处理以获得 Gaussian 可识别的文件格式JZ4.com,可使用软件Avogadro生成, ...
Gaussian 16 GaussView 6 GMMX 3模块 AMPAC程序 TCP-Linda 9 书籍:探索化学的奥秘Gaussian量化计算软件简介 Gaussian 软件是一款综合性量子化学计算程序包。目前被世界大多数行业内的化学家、生物学家、物理学家以及其它相关学科的科研工作者广泛使用。 Gaussian 软件基于量子力学而开发,可以预测各种化学环境中化合物和...
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Gaussian 16 produces accurate, reliable and complete models without cutting corners. A wide variety of methods makes Gaussian 16 applicable to a broad range of chemical conditions, problem sizes and compounds. Gaussian 16 provides state-of-the-art performance in single CPU, multiprocessor and multico...