跑一个《Centosstream 9 安装Gromacs 2023.1(GPU加速版)体验》中的例子,速度很快。 7 xtb的安装参考http://sobereva.com/421 解压命令 tar zxvf crest.tgz 8 Molclus安装参考:http://bbs.keinsci.com/thread-577-1-1.html 9 gaussian安装参考:http://bbs.keinsci.com/thread-10814-1-1.html 10 ORCA 的...
远程说不清楚，我只能说实测过G16 C.02结合xtb 6.7.1用上文的脚本联用没任何问题。严格确保安装和...
不能运行吗 external='./xtb.sh'sh是bash, windows系统没有bash, 用wsl就可以了
xtb是开源的,可以在https://github.com/grimme-lab/xtb/下载到源代码,如果想自行编译的话参看《Grimme的xtb程序的编译方法》(http://sobereva.com/521)。作为普通用户,直接用https://github.com/grimme-lab/xtb/releases里提供的预编译好的版本即可,文件名为比如xtb-191025.tar.xz这样的形式,代表2019年10月25日...
4.sobereva关于Gaussian与其他程序联用搜索过渡态的文章:将Gaussian与Grimme的xtb程序联用搜索过渡态、产生IRC、做振动分析、将Gaussian与ORCA联用搜索过渡态、产生IRC、做振动分析 5.sobereva关于过渡态计算结果作图的文章:在Origin中绘制能量折线图的方法 视频或者图文资料 ...
《将Gaussian与Grimme的xtb程序联用搜索过渡态、产生IRC、做振动分析》(http://sobereva.com/421) 还有一些特殊情况的势能面扫描,是使用本文提到的任何方法都没法直接实现的,比如对于pi-pi堆积二聚体,两个单体都平行于XY平面,想让其中一个单体在X,Y方向上进行二维扫描,像这种情况就只能自己写程序来解决了。具体来...
不开源，不方便写接口这样下去Gaussian一定会被其他计算软件取代，包括ORCA，xTB等等。
1/bin/xtb fragment.coord --opt verytight --input scan.inp --chrg 0 --uhf 0 4. Convet xyz into sdf obabel -ixyz xtbscan.log -osdf -O xtbscan.sdf 5. Extract dihedral scan result: extract_result_from_xtbscan.py xtbscan.sdf 3 2 1 8 CONF_ID,Angle,Relative_energy CONF_1,-...
https://github.com/grimme-lab/xtb の右側のreleaseからWindows用のバイナリをダウンロードして適当な場所に置きます。ここでは D:\programs\xtb-6.6.1 においたものとします。 適当な分子構造ビューワを用意します (Jmolなど)。 Gaussian for Windowsを利用する場合、インストールします。ここで...
站内信