安装fastx_toolkit (gcc, pkg-config) 我需要其中的fastx-clipper,从官网下载http://hannonlab.cshl.edu/fastx_toolkit/download.html最新版本的软件 用tar -jzf进行解压缩,解压缩之后,在文件夹中阅读README 得到提示: 那就安装gcc https://blog.csdn.net/xiaogugood/article/details/18400761 sudo apt-get install...
并可成功安装,但是在此基础上,安装fastx-toolkit,会报错undefined reference to `InputStreamWrapper::InputStreamWrapper(std::__cxx11::basic_string<char,std:b.编译时使用的gcc是7.3版本的,将其换成系统的4.8.5版本后,可以正常编译两个软件(此次采用的是这个方法)...
一:安装 (1)安装libgtextutils wgethttps://github.com/agordon/libgtextutils/releases/download/0.7/libgtextutils-0.7.tar.gztarxvf libgtextutils-0.7.tar.gzcdlibgtextutils-0.7./configure --prefix=/home/my/libgtextutils-0.7makemakeinstall*加载环境变量,再安装fastx-toolkit*export PKG_CONFIG_PATH=...
安装fastx toolkit的时候,步骤按https://blog.csdn.net/LotusWang0723/article/details/78723409 其中可能会出现如下报错 text_line_reader.cpp: In member function ‘bool TextLineReader::next_line()’: text_line_reader.cpp:47:9: error: cannot convert ‘std::istream {aka std::basic_istream<char>}...
conda install -c bioconda fastx_toolkit fastx_toolkit:过滤不合格序列 使用 参考 网站 博客 简介 http://not.farbox.com/post/fastx_toolkit#toc_1 中文 使用手册 https://www.jianshu.com/p/26762fcfb8f8 英文 使用手册 http://hannonlab.cshl.edu/fastx_toolkit/commandline.html ...