fastq_screen是可以用于检查是否存在污染序列的软件,需要先install再在终端中使用。FastQ Screen Documentation非常详细。在终端中使用也不难,input为上一步multiple_join后,修改了文件名的.fastq文件。 (需要将包含了污染序列的tag的文件去除,留下screen之后的文件,自己写脚本实现) (qiime1)multiple_split_libraries_fast...
使用FASTQ查看器:可以使用专门的软件来查看FASTQ文件,例如FASTQC、FastqScreen、Fastx toolkit等软件。这些...
执行上述脚本会通过「selenium」自动打开网页检索数据最终生成一个「SRP350862_download.sh」的脚本,之后在终端直接执行即可,当然也可以在脚本里面添加自动执行模块。如果使用中遇到报错大概是模块缺少,不建议继续耗费时间解决报错。 并行下载数据 代码语言:javascript 代码运行次数:0 复制 Cloud Studio代码运行 # 设置6个并...
screen -S GSE136447#创建后台程序(可以写shell脚本,存在问题“/r” 可以利用空格;解决换行问题,可以使用nohup XXX.sh &) cat /data/shift/GSE136447/GSE136447.txt|while read i#存放的为SAR序列号 do /data/biosoft/software/sratoolkit.2.9.6-1-ubuntu64/bin/prefetch -X 99999999999999 -O `pwd` $i ...
B. Alt+ Print Screen键 C. Shift+ F10键 D. Ctrl + F1键 查看完整题目与答案 电磁溢流阀用于多级压力控制或卸荷。 A. 正确 B. 错误 查看完整题目与答案 如果经常发现桥壳的通风孔向外排油,而轮边减速器经常缺油,一般来说是半轴油封方向装反或者损坏。() A. 正确 B....