1端 for i in `cat sample.txt|tr "\t" "_"`;do echo ${i};mv ${i##*_}_1.fastp.fastq.gz ${i}_1.fastp.fastq.gz;done 2端 for i in `cat sample.txt|tr "\t" "_"`;do echo ${i};mv ${i##*_}_2.fastp.fastq.gz ${i}_2.fastp.fastq.gz;done 第三步合并文件 安装bgzi...
image 现在要将多个lane 的fastq.gz合并,方便下步骤的分析。 方法1: cat HG251H_S11_L001_R1_001.fastq.gz HG251H_S11_L002_R1_001.fastq.gz HG251H_S11_L003_R1_001.fastq.gz HG251H_S11_L004_R1_001.fastq.gz >cat.fastq.gz 方法1: zcat HG251H_S11_L001_R1_001.fastq.gz HG251H_S11_L...
fastq本质上是一个ASCII码明文文本文件，所以不需要什么编程，一条命令就可以解决：cat *.fasta > output.fasta 拆分，把每一条拆成一个文件：awk '/^>/{f=++d".fasta"} {print > f}' input.fasta 你就会得到一堆001.fasta，002.fasta......
python -m barcode_splitter --bcfile Barcode-1_singlecol.txt ./C9DLHANXX_1_fastq.gz --prefix ./file1/ --suffix ".fastq" --gzipout --idxread 1 参数详解: --bcffile 后面跟着barcode文件,主要是个体一列,barcode一列,barcode的长度要一样 第二个文件就是要拆分的fastq文件 --prefix 这个代表文...
首先介绍了MATLAB中的movefile函数，该函数可以移动单个或多个文件，并提供了相应的参数设置。然后通过一个...
对的，可以的，直接cat也行，速度快：
所以最好是平行样合并组装。多样本混合组装就是一次将多个样本的数据输入拼接工具，拼接工具可以利用序列在...
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求助:两个fastq..我这里有两个fastq文件A和B。现在要每个文件的序列按每四个碱基分开,文件A每四个碱基和文件B的每四个碱基配对,最后要把文件A和B合并成一个文件C
关注 展开全部 您好,合并有什么要求吗?你是想将两个fastq文件按序列穿插合并还是怎么样? 追问 嗯嗯,是这样的,求你帮帮忙,你能帮助我吗 本回答被提问者和网友采纳 已赞过 已踩过< 你对这个回答的评价是? 评论 收起 1条折叠回答 其他类似问题2017...