GitHub is where people build software. More than 150 million people use GitHub to discover, fork, and contribute to over 420 million projects.
This tool is being intensively developed, and new features can be implemented soon if they are considered useful. If you have any additional requirement forfastp, please file an issue:https://github.com/OpenGene/fastp/issues/new simple usage ...
fastp程序是海普洛斯陈实富团队基于C++语言编写开发的FASTQ文件高效预处理工具(https://github.com/OpenGene/fastp),fastp程序体积小、支持多线程处理,且比Trimmomatic和Cutadapt等其它序列预处理工具更快。fastp于2018年9月发表在Bioinformatics期刊上,至2024年11月7日,引用次数高达15000+,文献引用参考:Shifu Chen, Yanqing...
### 安装libdeflate ### git clone https://github.com/ebiggers/libdeflate.git cd libdeflate cmake -B build cmake --build build cmake --install build ### 安装fastp ### # 抓取源码: git clone https://github.com/OpenGene/fastp.git # 编译: cd fastp make # 安装: sudo make install 四...
git clone https://github.com/ebiggers/libdeflate.git cd libdeflate cmake -B build cmake --build build cmake --install build ### 安装fastp ### # 抓取源码: git clone https://github.com/OpenGene/fastp.git # 编译: cd fastp make ...
### 安装libdeflate ### git clone https://github.com/ebiggers/libdeflate.git cd libdeflate cmake -B build cmake --build build cmake --install build ### 安装fastp ### # 抓取源码: git clone https://github.com/OpenGene/fastp.git # 编译: cd fastp make # 安装: sudo make install ...
联系支持:如果问题依旧无法解决,可以考虑联系fastp的开发者或社区寻求帮助。fastp的GitHub页面是一个获取帮助的好地方,同时也有许多生物信息学论坛和社区可以提供支持。 额外资源: fastp的GitHub页面:OpenGene/fastp 生物信息学相关论坛和社区,如Biostars、SeqAnswers等,也是寻求帮助的好地方。
如果你还没有使用fastp,马上登陆项目的网址去了解并使用吧: https://github.com/OpenGene/fastp fastp可以通过多种方式安装,推荐使bioconda安装,请参考: https://anaconda.org/bioconda/fastp 如果你喜欢自己捣鼓代码,可以选择自己编译; 如果你图简单,可以直接下载我们预编译好的版本:...
fastp是最近新出的一款NGS数据质量过滤工具,相比传统的QC工具,有两个主要特点,第一个就是运行速度快,第二个就是提供了质控前后数据详细统计结果。github地址如下 https://github.com/OpenGene/fastp 安装过程如下 代码语言:javascript 代码运行次数:0 代码运行 ...
Github:https://github.com/OpenGene/fastp 二、软件安装 1. conda或mamba 代码语言:bash 复制 # conda安装$ condainstall-cbioconda fastplong# mamba安装$ mambainstall-cbioconda fastplong 2. 二进制文件的安装 如果因为网络问题在服务器上无法直接下载,可以下载到本地然后上传服务器。