正因为其强大的功能和飞快的速度,其github项目在第一个版本发布至今才一个月左右,就已经收到了50多个star,这在生信软件小领域里面算是神速了!而且该软件更新频繁,至今已发布了14版,每一版都有新功能加入!该项目的github地址请戳:https://github.com/OpenGene/fastp 2功能特点 先来看一看该软件的功能列表: l ...
如果你还没有使用fastp,马上登陆项目的网址去了解并使用吧: https://github.com/OpenGene/fastp fastp可以通过多种方式安装,推荐使bioconda安装,请参考: https://anaconda.org/bioconda/fastp 如果你喜欢自己捣鼓代码,可以选择自己编译; 如果你图简单,可以直接下载我们预编译好的版本:...
这款fastp是其中的佼佼者,功能强大,操作简单,已经可以完成绝大部分的更新了。而且作者来自国内,加了微信可以直接交流。 一、功能分类: 数据质控过滤 二、软件官网: github.com/OpenGene/fas 三、软件介绍: fastp是一款用来处理测序数据的工具,作者是陈实富,来至于深圳海普洛斯公司。他们将这款工具开源免费使用,...
fastp是最近新出的一款NGS数据质量过滤工具,相比传统的QC工具,有两个主要特点,第一个就是运行速度快,第二个就是提供了质控前后数据详细统计结果。github地址如下 https://github.com/OpenGene/fastp 安装过程如下 代码语言:javascript 代码运行次数:0 wget http://opengene.org/fastp/fastp chmod a+x fastp 无论是...
Github: https://github.com/OpenGene/fastp 二、软件安装 1. conda或mamba 代码语言:bash AI代码解释 # conda安装 $ conda install -c bioconda fastplong # mamba安装 $ mamba install -c bioconda fastplong 2. 二进制文件的安装 如果因为网络问题在服务器上无法直接下载,可以下载到本地然后上传服务器。 下...
取消 支付完成 Watch 不关注关注所有动态仅关注版本发行动态关注但不提醒动态 3Star0Fork1 mirrors_OpenGene/fastp 代码Wiki统计流水线 服务 Releases Releases 功能基于仓库中的历史标记 建议使用类似 V1.0 的版本标记作为 Releases 点。 登录提示 该操作需登录 Gitee 帐号,请先登录后再操作。
fastp官方github 下载安装 ## conda: 但可能不是最新版本conda install -c bioconda fastp## 编译好的二进制版本,只适用于Linuxwget http://opengene.org/fastp/fastpchmoda+x ./fastp## 源码安装# get source (you can also use browser to download from master or releases)gitclonehttps://github.com/Ope...
git clone https://github.com/ebiggers/libdeflate.git cd libdeflate cmake -B build cmake --build build cmake --install build Step 3: download and build fastp #getsource(you can also use browser to download from master or releases)git clone https://github.com/OpenGene/fastp.git#buildcd ...
chmod a+x ./fastp ## 源码安装 # get source (you can also use browser to download from master or releases)git clone https://github.com/OpenGene/fastp.git # build cd fastp make # Install make install 3. 使⽤⽅法 ## 单末端测序数据，⾮压缩格式 fastp -i in.fq -o out.fq ## ...
### 解决方案: 参考链接( https://github.com... 虔诚的树 0 4651 openstack连接报错net_mlx5: cannot load glue library: libibverbs.so.1 2019-12-05 10:19 −部署openstack controller节点,第二天登录主机提示错误信息 Connecting to 10.1.10.151:22...Connection established.To escape to local shell...