library(tidyverse)library(openxlsx2)# https://web.expasy.org/protparam/# 导入氨基酸序列数据#---# 设置工作目录setwd("I:\\陕师大\\论文草稿\\Cardiac autophagy\\Atgs gene&protein\\果蝇-Expasy-ProtParam")# 读取文件fileNames<-dir()flyColNames<-c("Proteins","AA","pI","Mw","GRAVY","Formula...
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First, use the ProtParam physical/chemical analysis tool at the Expasy Protein analysis Server (in Switzerland). For each of the 4 proteins, record the number of amino acids, the top 4 most common amino acids, and the % of charged amino acids (sum of + and – charged divided by total ...
(1)选择Protparam程序和___对蛋白质序列进行氨基酸组成、分子质量和等电点等基本性质分析; (2)蛋白质的同源性搜索分析,使用Similarity searches的BLAST; (3)在Pattern and profile searches中选择interPro Scan进行结构域或motif搜索。 (4)在post-translational modification prediction选择signalP对蛋白质序列进行信号肽...
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