【方法】以Pc-prx4为目的基因,通过相关网站和软件(Expasy,Translate tool,SMART,Expasy ProtParam tool,BLASTx,MEGA-X)进行生物信息学分析.通过qRT-PCR检测Pc-pr... 张明达,李倩倩,张文硕,... - 《福建农业学报》 被引量: 0发表: 2023年 加载更多研究...
ExPASy使用初探
38、測。7.Primary structure analysis主要結構的分析7-1 ProtParam - Physico-chemical parameters of a protein sequence (amino-acid and atomic compositions, pI, extinction coefficient, etc.) 蛋白質序列的物理及化學變量分析(胺基酸、原子結構、等電點.等)7-2 Compute pI/Mw - Compute the theoretical pI...
(pI,Mw) ProtParam tool 酶切位点 PeptideCutter,Enzyme 数据库 疏水性 ProtScale 质谱数据分析 AACompIdent MultiIdent PROWL ProteinProspector 家族分析 相似序列搜索 BLAST,FASTA 多序列比对 clustal 保守结构域分析 InterPro, CDD, PROSITE 模式位点分析 PROSITE ...
1.ProtParamtool:蛋白质的氨基酸组成、分子量、PI等基本特征的分析。 将斑头雁的血红蛋白序列输入该工具中,可以得到如下结 果: Numberofaminoacids:142 Molecularweight:15467.8 TheoreticalpI:8.54 Aminoacidcomposition: Ala(A)1913.4% Arg(R)32.1% Asn(N)32.1% Asp(D)74.9%…… Totalnumberofnegativelychargedresid...