est序列名词解释 EST(Expressed Sequence Tag)是指表达序列标签,是一段短的DNA序列,通常是从cDNA文库中通过随机测序得到的。EST序列通常包含一个基因的部分编码区域,可以用来鉴定和筛选新的基因。 EST序列的获得通常是通过对cDNA文库进行随机测序得到的。在测序过程中,会得到大量的短序列,这些序列可能来自于不同的基因...
日本血吸虫EST序列 日本血吸虫EST序列是裂体科、裂体属微生物。形态特征 雌雄合抱。生态习性 有在终宿主体内的有性生殖和在中间宿主钉螺体内的无性生殖。成虫寄生在终宿主一定部位的静脉内。雌虫寄生在。
在这一应用中,从ESTs发展起来的PCR或杂交分析可用来识别YACs、BACs或其他含有大片段插入克隆类型的载体,它们是构建基因组物理图谱的基础,将EST与基因组物理图谱相比较即可辨认出含有剩余基因序列的基因组区间,包括调控基因表达的DNA控制元件,对这些元件进行分析就有可能获得对基因功能的详细了解。物理图谱与遗传图谱间的...
EST,即Expressed Sequence Tag,是一种分子标签,它代表了一个完整基因的一小部分,通常从20bp到7000bp不等,平均长度为360±120bp。它是通过从cDNA克隆随机选取,进行5'端和3'端单一次测序获得的。由于测序的随机性和cDNA文库的复杂性,一个EST可能代表多个基因或基因组片段,这些相似的序列集合称为...
由于EST来源于cDNA,因此每一条EST均代表了文库建立时所采样品特定发育时期和生理状态下 的一个基因的部分序列。使用合适的比对参数,大于90%的已经注释的基因都能在EST库中检测到(Baileyetal.,1998)。ESTs可以做为其它基因预测算法的补充,因为它们对预测基因的交替剪切和3‘非翻译区很有效。ESTs应用4:ESTs与SNPs...
1991年,文特尔和他的团队开启了一次高通量cDNA测序的里程碑式研究。基本策略是随机选择cDNA克隆,然后从它们插入部分的两端进行一次自动化、单次测序。他们将这类新的序列类型命名为EST,其特点是短(通常约400-600碱基)且相对较不准确(约2%的误差)。单次测序是降低成本的关键。通常,不会一开始就...
基因的电子定位采用NCBI的电子PCR程序进行检索,寻找EST序列上是否存在序列标签位点(sequence tagged sites,STS),STS作为基因组中的单拷贝序列,是新一代的遗传标记系统,其数目多,覆盖密度较大,达到平均每1kb一个STS或更密集。将寻找到的STS与相应的染色体相比较,即可将此序列定位在该染色体上。
EST(表达序列标签)测序服务 EST(表达序列标签)测序服务 表达序列标签(expressed sequence tags,ESTs)是指从动植物不同组织来源的cDNA序列,⼴泛应⽤于基因识别、绘制基因表达图谱、寻找新基因等研究领域。⽽随着⼈类基因组计划的开展,在基因结构、定位、表达和功能研究等⽅⾯都积累了⼤量的数据,如何...
EST序列,即Expressed Sequence Tags,是基因组研究中的重要工具,但并非完美无缺。ESTs由反转录mRNA生成,其精确度受限于剪切后的单列序列位点,通常只能达到97%的准确度。由于表达倾向(expression bias)的存在,低表达的基因在EST数据库中不易被发现,而高表达的基因则可能过度代表。为了构建理想的cDNA...