答:STS是序列标记位点(sequence-tagged site)的缩写,是指染色体上位置已定的、核苷酸序列已知的、且在基因组中只有一份拷贝的DNA短片断,一般长200bp-500bp。它可用PCR方法加以验证。将不同的STS依照它们在染色体上的位置依次排列构建的图为STS图。在基因组作图和测序研究时,当各个实验室发表其DNA测序数据或构建成的...
EST(Expressed Sequence Tags)：表达序列标记 STS(Sequence Tagged Sites)：序列标记位点 GSS(Genome Survey Sequences)：基因组概览序列
1.EST标记技术的优点 与一般分子标记技术相比,EST标记技术的优越性有以下几点。①EST标记可直接和一个表达基因相关,且便于转变成为STS标记。因为表达基因只占整个基因组的2%左右,EST标记反映的只是编码部分的基因,所以利用EST标记可以直接获得有关基因表达的信息;②用EST标记替代基因组测序将使研究费用大大降低,并大大...
麦类作物学报 2012,32(3):393—397 JournalofTriticeaeCrops 簇毛麦1V染色体臂的EST—STS标记的开发与应用 赵万春,董剑,高翔,陈其皎,李晓燕,石引岗,陈良国 (西北农林科技大学农学院,陕西杨凌7121oo) 摘要:为了给小麦远缘亲本的研究和利用提供参考,根据已定位于普通小麦1DS和1BI上的EST序 列设计96对STS引物,对...
基因的电子定位采用NCBI的电子PCR程序进行检索,寻找EST序列上是否存在序列标签位点(sequence tagged sites,STS),STS作为基因组中的单拷贝序列,是新一代的遗传标记系统,其数目多,覆盖密度较大,达到平均每1kb一个STS或更密集。将寻找到的STS与相应的染色体相比较,即可将此序列定位在该染色体上。 4.3IMAGE克隆的索取 许...
基因的电子定位采用NCBI的电子PCR程序进行检索,寻找EST序列上是否存在序列标签位点(sequence tagged sites,STS),STS作为基因组中的单拷贝序列,是新一代的遗传标记系统,其数目多,覆盖密度较大,达到平均每1kb一个STS或更密集。将寻找到的STS与相应的染色体相比较,即可将此序列定位在该染色体上。
sts分子标记引物及其应用 技术领域 1.本发明属于分子生物学及基因工程技术领域,具体的说是泸定百合抗病相关基因cat的est ‑ sts分子标记引物及其应用。 背景技术: 2.百合为百合科百合属多年生球根花卉,花姿优美,色彩艳丽,深受人们喜爱,是世界五大鲜切花之一,由百合尖孢镰刀菌转化型引起的百合鳞茎腐烂病是目前百合生产...
基因的电子定位采用NCBI的电子PCR程序进行检索,寻找EST序列上是否存在序列标签位点(sequence tagged sites,STS),STS作为基因组中的单拷贝序列,是新一代的遗传标记系统,其数目多,覆盖密度较大,达到平均每1kb一个STS或更密集。将寻找到的STS与相应的染色体相比较,即可将此序列定位在该染色体上。
为了给小麦远缘亲本的研究和利用提供参考,根据已定位于普通小麦1DS和1BL上的EST序列设计96对STS引物,对中国春、簇毛麦、中国春-簇毛麦的1V附加系和易位系进行多态性分析,开发出4个簇毛麦1V染色体臂的STS标记。其中,BE499250-STS和BE591682-STS/RsaⅠ为共显性标记,可以扩增出1条1VS片段,同时还可以扩增出1条1D...
摘要 本发明提供一种黑麦1RS染色体特异的EST-STS标记引物2,其特征在于:该标记引物是根据小麦第一部分同源群的EST序列一BE443401为模板设计而得到的,其序列为:STSWE3F:5’-GCATCTGCCAACACTCTCAA-3’,STSWE3R:5’ACGGCAGCATGTAGAGACAA-3’。引物STSWE3扩增出的两条大小为1680bp和1750bp的特异片段位于黑麦1...