S.TS是序列标记位点(sequence-taggedsite)的缩写,是指染色体上位置已定的、核苷酸序列已知的、且在基因组中只有一份拷贝的DNA短片断,一般长200bp-500bp。它可用PCR方法加以验证。将不同的STS依照它们在染色体上的位置依次排列构建的图为STS图。在基因组作图和测序研究时,当各个实验室发表其DNA测序数据或构建成的物...
1.EST标记技术的优点 与一般分子标记技术相比,EST标记技术的优越性有以下几点。①EST标记可直接和一个表达基因相关,且便于转变成为STS标记。因为表达基因只占整个基因组的2%左右,EST标记反映的只是编码部分的基因,所以利用EST标记可以直接获得有关基因表达的信息;②用EST标记替代基因组测序将使研究费用大大降低,并大大...
EST(Expressed Sequence Tags)：表达序列标记 STS(Sequence Tagged Sites)：序列标记位点 GSS(Genome Survey Sequences)：基因组概览序列
基因的电子定位采用NCBI的电子PCR程序进行检索,寻找EST序列上是否存在序列标签位点(sequence tagged sites,STS),STS作为基因组中的单拷贝序列,是新一代的遗传标记系统,其数目多,覆盖密度较大,达到平均每1kb一个STS或更密集。将寻找到的STS与相应的染色体相比较,即可将此序列定位在该染色体上。 4.3IMAGE克隆的索取 许...
4个簇毛麦1V染色体臂的STS标记。其中,BE49925O—STS和BE591682一STS/RsaI为共显性标记,可以扩 增出1条1VS片段,同时还可以扩增出1条1DS片断,能将1DS和1AS、1BS区分开采;BE581358一STS/Hae Ⅲ和BE585781一STs/RaI是显性标记,能分别扩增出2条和1条1VI片段,但扩增的小麦染色体片段不能 区分1DI和1A、1B。
基因的电子定位采用NCBI的电子PCR程序进行检索,寻找EST序列上是否存在序列标签位点(sequence tagged sites,STS),STS作为基因组中的单拷贝序列,是新一代的遗传标记系统,其数目多,覆盖密度较大,达到平均每1kb一个STS或更密集。将寻找到的STS与相应的染色体相比较,即可将此序列定位在该染色体上。
SSR标记又称为sequencetaggedmicrosatellitesite,简写为STMS,是目前最常用的微卫星标记之一。由于基因组中某一特定的微卫星的侧翼序列通常都是保守性较强的单一序列,因而可以将微卫星侧翼的DNA片段克隆、测序,然后根据微卫星的侧翼序列就可以人工合成引物进行PCR扩增,从而将单个微卫星位点扩增出来。由于单个微卫星位点重复单...
摘要: 本发明提供一种黑麦1RS染色体特异的EST-STS标记引物2,其特征在于:该标记引物是根据小麦第一部分同源群的EST序列一BE443401为模板设计而得到的,其序列为:STS<SUB>WE3</SUB>F:5’-GCATCTGCCAACACTCTCAA-3’,STS<SUB>WE3</SUB>R:5’-ACGGCAGC... 查看全部>> ...
基因的电子定位采用NCBI的电子PCR程序进行检索,寻找EST序列上是否存在序列标签位点(sequence tagged sites,STS),STS作为基因组中的单拷贝序列,是新一代的遗传标记系统,其数目多,覆盖密度较大,达到平均每1kb一个STS或更密集。将寻找到的STS与相应的染色体相比较,即可将此序列定位在该染色体上。
应用免疫组织化学法,检测 STS、EST 在乳腺癌组织及正常乳腺组织中的表达,采用卡方检验和 spearman 法分析其表达及相关性。结果 乳腺癌组织中 STS 蛋白表达水平高于正常乳腺组织,差异有统计学意义(P =0. 000)。EST 在乳腺癌和正常乳腺组织中的表达差异无统计学意义(P =0. 367)。在乳腺癌组织中 STS 与 EST ...