通过EST-SSR分子标记技术,可以分析不同绵羊品种对疾病的抗性和易感性,确定与疾病相关的EST-SSR位点,为疾病的分子诊断和治疗提供科学依据。同时,EST-SSR分子标记技术还可以为绵羊疾病的基因筛选和基因定位提供重要的遗传信息,为疾病的预防和治疗提供更加精准的遗传标记。EST-SSR技术面临的挑战和局限性 尽管该技术已经...
例如,我们可以利用与产毛量相关的EST-SSR标记,选择产毛量高的个体进行繁殖,从而提高绵羊的经济效益。(四)构建绵羊遗传图谱: EST-SSR标记可以用于构建绵羊的遗传连锁图谱,为基因定位和克隆提供重要框架。高密度的遗传图谱能够提高基因定位的精度,为进一步研究绵羊重要经济性状的遗传机制奠定基础。三、挑战与展望:...
est-ssr(expressed sequence tag-derived simple sequence repeat)标记是利用EST数据(表达序列标签)进行简单重复序列的分析,并进行标记。est-ssr标记是一种分子标记技术,利用基因组中的微卫星序列进行检测,并通过PCR扩增技术进行鉴定。由于EST数据是从不同组织、不同生长阶段的cDNA样本中获得的,因此est-ssr标记具有较强...
本研究旨在开发辣椒EST-SSR标记,并应用该标记于辣椒品种的育种工作中,以实现辣椒的高效精准选育。具体研究内容包括: 1、建立辣椒品种的EST数据库和SSR标记库。 2、筛选和确定基因编辑所需的EST-SSR标记。 3、利用EST-SSR标记对辣椒品种进行育种。 4、评估育种效果和提高育种策略。 三、研究方法和流程 1、实验材料...
EST—SSR是基于表达序列标签开发微卫星的一种新型分子标记,与基因组SSR相比,EST-SSR具有在植物物种之间可转移性的优点。目前,EST—SSR被广泛应用于植物基因组学研究如遗传图谱构建、比较作图、遗传多样性评价、种质鉴定、系统发育与进化研究等方面。引物(primer),是一小段单链DNA或RNA,作为DNA复制的...
2、SSR标记的基本原理:根据微卫星序列两端互补序列设计引物,通过PCR反应扩增微卫星片段,由于核心序列串联重复数目不同,因而能够用PCR的方法扩增出不同长度的PCR产物,将扩增产物进行凝胶电泳,根据分离片段的大小决定基因型并计算等位基因频率。3、在真核生物中,存在许多2-5bp简单重复序列,称为“微卫星...
36、EST-SSR标记开发 转载:http://fhqdddddd.blog.163.com/blog/static/1869915420124131096557/ MISA工具提供批量识别和定位简单重复序列(SSR),EST序列或是基因组序列都可以。另外,还提供一个与批量设计引物Primer3的接口工具,通过这个工具,可以把MISA识别出来的SSR,转为Primer3需要的格式,从而方便批量设计引物。
建立EST-SSR标记要经济得多,而且EST-SSR标记来源于DNA的转录区域,比gSSR标记具有更高的通用性,此外,标记-信息量高。 开发EST-SSR原理基于生物信息学手段的可开发SSR的方法。在数据库中已存在大量的可免费下载EST序列数据并剔除冗余EST序列,再通过SSR搜索软件获得SSR位点信息,然后根据SSR位点两侧的核酸序列信息的统计...
· 生物技术通报 BIOTECHNOLOGY BULLETIN 2016, 32(2):178-184 中间锦鸡儿转录组 EST-SSR 标记系统性识别与 引物筛选 王光霞 杨杞 王瑞刚 李国婧 (内蒙古农业大学生命科学学院,呼和浩特 010018) 摘要: 旨在对中间锦鸡儿转录组数据库 EST 信息进行 SSR 系统性识别和初步验证,为进一步 SSR 分子标记...
建立EST-SSR标记要经济得多,而且EST-SSR标记来源于DNA的转录区域,比gSSR标记具有更高的通用性,此外,标记-信息量高。 开发EST-SSR原理基于生物信息学手段的可开发SSR的方法。在数据库中已存在大量的可免费下载EST序列数据并剔除冗余EST序列,再通过SSR搜索软件获得SSR位点信息,然后根据SSR位点两侧的核酸序列信息的统计...