通过EST-SSR分子标记技术,可以分析不同绵羊品种对疾病的抗性和易感性,确定与疾病相关的EST-SSR位点,为疾病的分子诊断和治疗提供科学依据。同时,EST-SSR分子标记技术还可以为绵羊疾病的基因筛选和基因定位提供重要的遗传信息,为疾病的预防和治疗提供更加精准的遗传标记。EST-SSR技术面临的挑战和局限性 尽管该技术已经...
标记多态性不足: 某些EST-SSR标记的多态性较低,限制了其在一些研究中的应用。需要持续开发新的、多态性更高的分子标记。数据资源整合: 缺乏一个全面、开放共享的绵羊EST-SSR标记数据库,限制了该技术的广泛应用。需要加强国际合作,建立共享平台,促进数据资源的整合与利用。技术标准化: 不同实验室之间EST-...
est-ssr(expressed sequence tag-derived simple sequence repeat)标记是利用EST数据(表达序列标签)进行简单重复序列的分析,并进行标记。est-ssr标记是一种分子标记技术,利用基因组中的微卫星序列进行检测,并通过PCR扩增技术进行鉴定。由于EST数据是从不同组织、不同生长阶段的cDNA样本中获得的,因此est-ssr标记具有较强...
1、简单重复序列(Simple Sequence Repeat,SSR) 简单重复序(SSR)也称微卫星DNA,其串联重复的核心序列为1一6 bp,其中最常见是双核苷酸重复,即(CA) n和(TG) n每个微卫星DNA的核心序列结构相同,重复单位数目10一60个,其高度多态性主要来源于串联数目的不同。2、SSR标记的基本原理:根据微卫星序列...
EST—SSR是基于表达序列标签开发微卫星的一种新型分子标记,与基因组SSR相比,EST-SSR具有在植物物种之间可转移性的优点。目前,EST—SSR被广泛应用于植物基因组学研究如遗传图谱构建、比较作图、遗传多样性评价、种质鉴定、系统发育与进化研究等方面。引物(primer),是一小段单链DNA或RNA,作为DNA复制的...
36、EST-SSR标记开发 转载:http://fhqdddddd.blog.163.com/blog/static/1869915420124131096557/ MISA工具提供批量识别和定位简单重复序列(SSR),EST序列或是基因组序列都可以。另外,还提供一个与批量设计引物Primer3的接口工具,通过这个工具,可以把MISA识别出来的SSR,转为Primer3需要的格式,从而方便批量设计引物。
EST标记是根据EST本身的差异而建立的分子标记。根据开发的方法不同, EST标记可分为5类:①EST-PCR标记,它是以PCR为基础,根据EST序列设计引物并对特定区域进行扩增而揭示差异的标记;②EST-SSR标记,它以PCR技术为核心,操作简便经济,是目前研究和应用最多的一类标记;③EST-SNP标记,它是以特定EST区段内单个核苷酸差异...
本研究旨在开发辣椒EST-SSR标记,并应用该标记于辣椒品种的育种工作中,以实现辣椒的高效精准选育。具体研究内容包括: 1、建立辣椒品种的EST数据库和SSR标记库。 2、筛选和确定基因编辑所需的EST-SSR标记。 3、利用EST-SSR标记对辣椒品种进行育种。 4、评估育种效果和提高育种策略。 三、研究方法和流程 1、实验材料...
我们也开发了 EST-SSR 和靶位区域扩增多态性 〔Targetreginaplifiedplyrphis,TRAP〕标记[8,9],并在柿品种间进展了遗传分 析,但是这些标记对于柿属其他种植物是否能通用尚需进一步试验。本研究利用前期 开发的 11 个 EST-SSR 标记对柿属 15 个种 20 份试材进展了标记通用性评价,旨在为柿 及其近缘种种质...
建立EST-SSR标记要经济得多,而且EST-SSR标记来源于DNA的转录区域,比gSSR标记具有更高的通用性,此外,标记-信息量高。 开发EST-SSR原理基于生物信息学手段的可开发SSR的方法。在数据库中已存在大量的可免费下载EST序列数据并剔除冗余EST序列,再通过SSR搜索软件获得SSR位点信息,然后根据SSR位点两侧的核酸序列信息的统计...