ERCC的全称是 External RNA Controls Consortium,翻译过来就是外源RNA参照协会,这是个专门为了定制一套spike-in RNA而成立的组织。该组织成立于2003年,主要的工作就是设计了一套非常好用的spike-in RNA,方便当时的microarray,qRT-PCR以及后来的RNA-Seq进行内参定量。 早期的用DNA芯片是一个突破性的技术,它可以通过测...
ERCC校准方法基于一种称为“spike-in”的技术,即将已知浓度的外源性RNA分子添加到待测样本中。这些外源性RNA分子与待测样本中的内源性RNA分子一同被转录成cDNA,并通过测序技术进行测序。通过比较外源性RNA分子的实际浓度和预期浓度,可以评估RNA测序的准确性和灵敏度。 ERCC校准方法的应用非常广泛。首先,它可以用于评估...
Ambion™ ERCC RNA 内参对照用于在使用多种样品和平台进行的一项实验中和多项验之间创建 RNA 的标准基线测定值。采用两种内参混合物配方(图1),可以对多种指标(如灵敏度或动态范围)进行检查,以评估一项实验中或不同实验间的不同参数(图2)。而且,两种样品中表达水平幅度变化的比率,可通过ExFold RNA Spike-In 1...
Variation in RNA expression data can be attributed to a variety of factors including the quality of the starting material, the level of cellularity and RNA yield, the platform employed, and the person performing the experiment. To control for these s
The ERCC spike-in mix contains 92 transcripts of known concentration. The set is organized into four subgroups, each containing 23 controls that span six logs of dynamic range in concentration. The ERCC mix is added t...
External RNA Controls Consortium (ERCC) ERCC是啥? 外部RNA控制联盟,就是一套RNA-seq,基因表达检测过程中的控制系统,使得结果具有可重复性。 RNA Spike-in Controls for Gene Expression While early gene expression measurements with DNA microarrays were groundbreaking in their ability to reveal biological ...
Control Type: ERCC RNA Control Product Line: Ambion™ 储存 This kit contains:• 10 µl ERCC RNA Spike-In Mix 1• 1.75ml Nuclease-free Water-Do not store the Spike-In Mixes in a frost-free freezer.-Store ERCC RNA Spike-In Mix 1 at –20°C-Store Nuclease-free Water at an...
Here we hypothesized that the existence of HBV products may interfere with cellular nucleotide excision repair (NER) through microRNA-mediated gene regulation. We found that NER was impaired in HepG2.2.15 cells, a stable HBV-expressing cell line, compared with its parental cell line HepG2. ...
MicroRNA作为一种转录后调节机制.在多个生 物学过程中发挥作用。最近的研究表明,非小细胞 肺癌放疗后,microRNA的表达谱发生变化。其中就 包括miR一192 和 miR一215t 。而生物信息学预测表 明ERCC3 可 能是 miR一192 和 miR一215 潜在 的共 同
Ambion™ ERCC RNA 内参对照用于在使用多种样品和平台进行的一项实验中和多项验之间创建 RNA 的标准基线测定值。采用两种内参混合物配方(图1),可以对多种指标(如灵敏度或动态范围)进行检查,以评估一项实验中或不同实验间的不同参数(图2)。而且,两种样品中表达水平幅度变化的比率,可通过ExFold RNA Spike-In 1...