ENC vs GC3s values for TP53 gene.Tarikul, Huda MazumderSupriyo, Chakraborty
将数据整理到excel中,第一列GC3s,第二列ENC值,然后复制到剪切板,通过read.table()函数读入 df<-read.table("clipboard",header=T)自定义理论ENC计算函数ENC<-function(x){return(2+x+29/(x^2+(1-x)^2))}生成绘制曲线需要的数据 x<-seq(0,1,by=0.005)y<-ENC(x)df1<-data.frame(A=x,B=y)绘...
df<-data.frame(GC3s=sample(seq(0,1,by=0.05),15), ENC=sample(1:60,15)) 绘图 library(ggplot2) ggplot(df1,aes(x=A,y=B))+geom_line(size=1)+ geom_point(data=df,aes(x=GC3s,y=ENC))+xlim(0,1)+ ylim(0,70)+labs(x="GC3s",y="ENC")+theme_bw() 1. 2. 3. 4. 5. 6....
标准曲线计算公式为:ENc= 2 + GC3s + 29/[GC3s2 + (1 -GC3s)2][18];以各条CDS序列的A3/(A3+T3)为纵坐标,G3/(G3+C3)为横坐标作散点图进行PR2-plot分析,散点图的中心位置(当A=T,C=G)代表无
QGO:FqPg(89Ja(X'JT_]ksm@l21ris+]'_2a1d[>oI$/E7\BS9'GC4G_brIJF<eg_r(i)D6/75($JfbW+Ar_kV=@F#[jP_4j/hU6dp#=%SCflOC\)UMsn+i6e1_c5/jf1f!1V4#,-mA(]QTmDeQJ`o,8AE+kcm)!La))dS2CU`KUW%fqTJ!u6;X(cGV?T.PeI,e4!kB7Yla0nlRYQ=&cnLRGrtjSP@"MYh3G%F;L...
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