综合起来的EMBL-EBI数据库功能是一款针对人类蛋白GO功能分析的综合注释数据库。Gene Ontology分为分子功能,生物过程和细胞组成三个部分。蛋白质或者基因可以通过ID对应或者序列注释的方法找到与之对应的GO号,而GO号可对应到Term,即功能类别或者细胞定位。 QuickGO数据库和实验室研究人员及外泌体数据库Exocarta 和...
欧洲核苷酸数据库（EMBL-EBI）：欧洲核苷酸数据库是由欧洲生物信息学研究所（European Bioinformatics Institute，EMBL-EBI）管理的数据库之一，成立于1980年代末期。它收集了来自欧洲和其他地区的大量核苷酸序列数据，包括基因组、转录组、蛋白质序列等信息。日本DNA数据银行（DDBJ）：日本DNA数据银行是由日本国立遗传学研究...
EMBL-EBI具有开放性、兼容性、综合性的特点,并使用专家注释系统提高数据质量。 ⑴Ensemble EMBL-EBI现有Ensembl和Ensembl Genomes基因组序列数据库(http://www.ensembl.org/index.html),其中Ensembl提供高质量、综合注释的脊椎动物基因组数据,Ensembl Genomes提供非脊椎动物全基因组数据,该数据库并不包含原核生物数据。En...
EMBL-EBI，即欧洲分子生物学实验室和欧洲生物信息学研究所，它们分别是1974年由欧洲14国及以色列合作创立和1982年建立的非营利科研机构。它们的主要目标是通过合作推动分子生物学基础研究和生物信息学工具的发展。其中，EBI的QuickGO数据库专注于人类蛋白功能的Gene Ontology（GO）分析，它将蛋白质或基因通过...
欧洲生物信息学研究所(European Bioinformatics Institute, EBI)创建的一个核酸序列数据库。EMBL的数据来源主要有两部分，一部分由科研人员或某些基因组测序机构通过计算机网络直接提交，另一部分则来自科技文献或专利(Stoesser等, 1998)。EMBL与DDBJ、GenBank建有合作关系，他们分别在全世界范围内收集核酸序列信息，每天都...
InterPro是EBI进行蛋白质分类的主要资源。 在InterPro中,将来自多个不同数据库的模式,Profile,指纹和HMM整合到一个可搜索的资源中,从而可以方便地访问其预测功能,而无需单独访问成员数据库(请参见图18的概述,用于构建InterPro的数据库)。 通过组合不同的数据库和签名类型(signature types),InterPro可以利用其各自的...
TrEMBL也是 EBI 和 SIB 共同管理的一个数据库,他与 Swiss-Prot 的区别是: TrEMBL 里的蛋白质序列注释是由计算机完成的,它包含了 EMBL 核酸序列数据库中为蛋白质编码的核酸序列的所有翻译产物。换言之,TrEMBL 是通过计算机,把核酸序列数据库里能编码蛋白的核酸序列都翻译成了蛋白质序列,然后把这些计算机翻译出来...
Bairoch于1986年创建,目前由瑞土生物信息学研究所 (Swiss Institute of Bioinformatics, SIB)和欧洲生物信息学研究所(EBI)共同维护和管理。蛋白质序列数 据库 TrEMBL (Translated EMBL. Nucleotide Sequence Data Library)是瑞士生物信息学研究所的蛋白质 序列数据库 SWISS-PROT的一个增补本,TrEMBL增加了一些SWISS-...