pip install easyfig==2.0.0 回车即可,如图所示,等待安装完成。(注意:1.要联网;2.关掉梯子VPN)如果中途出现红字,说明因网络原因安装失败,检查网络,并重新做此步即可。 Win+R,输入``cmd``回车 2.3 启动easyfig 对于Windows用户,按下组合键Win+R,输入easyfig直接回车即可!如果是Windows 11,直接在电脑自带的搜索框...
官网基础效果图 软件主页 http://mjsull.github.io/Easyfig/ 在这里可以找到下载入口、官方使用指南和引用方法 2.在主页选择download,下载windows版本安装包 3.把下载的压缩文件解压到一个文件夹下,没有安装程序,直接双击Easyfig.exe就会弹出图形界面(没错就是这么丑,请不要嫌弃它) 无需安装,双击exe文件就能用 4....
Easyfig安装、基础绘图 这是一篇针对Easyfig初学者的教程,主要内容为Easyfig的下载、blast安装,确保软件能正常运行。 注意:Easyfig的安装路径、使用的各个文件路径、生成的各个文件路径,都不要有中文/空格/非法字符。 Easyfig、blast安装 基础绘图
首先,访问Easyfig官方网站下载并安装软件。在下载页面选择适合操作系统的版本,我选择了Windows版本。安装完毕后,打开Easyfig软件。在主界面中,点击“Blast”选项,选择安装的blast软件的位置。在“Image”区域,用户可以调整绘图参数。在“Annotation”选项中,可以修改基因的颜色和基因标签。默认情况下,gene...
这种方法在Easyfig系列课程《Easyfig:基因组结构分析神器》中进行了详细介绍,主要是依靠“直接选择工具”对指定基因图形进行分别着色。 其二,直接在Genbank文件中添加颜色注释信息,并使用该新文件重新生成图示化结果。它的特点是需要在注释前清楚划分每一个基因的功能分类,并给每一种分类指定的颜色。 以下是两种常用的...
🖥️ 打开EasyFig界面,点击“Add Feature Files”按钮,上传GenBank文件。然后选择“Generate TBLASTN Files”(根据具体情况选择核酸类型),并找到BLASTN软件的位置,确认上传。 🔄 如果系统显示“complete”,则表示BLASTN可用。如果未成功,可能是BLASTN位置未找到,这时需要手动确认BLASTN的位置,并重复上述步骤。
1 下载Easyfig_win_2.1.zip,软件在sourceforge,解压,双击Easyfig_win_2.1.exe即可运行。2 点击Add feature file,输入第一个要比较的基因gbk格式的注释文件,再次点击Add feature file,输入第二个要比较的基因gbk格式的注释文件。要比较更多,可以继续添加。3 点击Add blast file,输入blast+的-outfmt 6格式...
在使用Easyfig作图软件上传数据时,首先,您需要通过左侧框中的"add feature file"功能,将您需要对比的fasta或gb格式文件放入软件中。若计划在图像上添加注释信息,则需准备gb格式的序列文件。接下来,根据您的需求调整图像参数,完成设置后点击"generate blastn files"进行blast对比操作。一旦生成对比结果,...
Easyfig绘图需要注释文件、比对文件和参数信息,三者缺一不可。通常出现此问题是因为添加的注释文件,其文件名、文件路径或选择保存的blast比对路径存在非法字符,导致序列blast比对失败。最常见的原因是存在空格。某些用户习惯将保存路径设定为桌面,但需要注意的是,桌面路径会包含计算机用户名,如果用户名包含...
各位老师好,最近做了全基因组测序,想把结果用easyfig软件来进行基因环境比较,但是这个软件在运行blast...