BLAST中的E值(E-value)是什么意思? BLAST是指Basic Local Alignment Search Tool,是生物信息学中的一种序列比对算法,用于寻找蛋白质或核酸的相似序列。 下面是一个BLAST结果, 后面有两个值,一个是S值,一个E值。可以发现,结果是依据S值的高低来显示的。 S值表示两序列的同源性,分值越高表明它们之间相似的程度...
BLAST中使用的统计值有概率p值和期望e值。 E期望值(E-value)这个数值表示你仅仅因为随机性造成获得这一比对结果的可能次数。这一数值越接近零,发生这一事件的可能性越小。从搜索的角度看,E值越小,比对结果越显著。默认值为10,表示比对结果中将有10个匹配序列是由随机产生,如果比对的统计显著性值(E值)小于该值...
一般的,当我们使用BLAST(是一种用于在数据库当寻找任何蛋白质或者基因序列与你的目标序列一致的程序)时,我们会注意到这里有一个E值。那么这个E value是什么呢?怎么来理解这个值呢? 下面是一个平常的blast结果, 后面有两个值,一个是S值,一个E值。可以发现,结果是依据S值的高低来显示的。 S值表示两序列的同源...
BLAST是一种用于生物信息学中蛋白质或核酸序列比对的算法，其结果中包含两个关键值：S值与E值。S值反映两序列间的同源性，数值越高表示相似程度越大。E值则是评价S值可靠性的指标，它表示在随机情况下，其他序列与目标序列的相似度超过S值的概率。因此，E值越低，S值的结果越可信。E值的计算公式为...
blast结构的 e-value什么意思一般的,当我们使用BLAST(是一种用于在数据库当寻找任何蛋白质或者基因序列与你的目标序列一致的程序)时,我们会注意到这里有一个E值。那么这个E value是什么呢?S值表示两序列的同源性,分值越高表明它们之间相似的程度越大。E值就是S值可靠性的评价。它表明在随机的情况下,其它序列与...
一般的,当我们使用BLAST(是一种用于在数据库当寻找任何蛋白质或者基因序列与你的目标序列一致的程序)时,我们会注意到这里有一个E值。那么这个E-value是什么呢?怎么来理解这个值呢?下面是一个平常的blast结果, Sequences producing significant alignments: Score (S) E giMoth_2374|sporulation – prote… 202 2e...
一般的,当我们使用BLAST(是一种用于在数据库当寻找任何蛋白质或者基因序列与你的目标序列一致的程序)时,我们会注意到这里有一个E值。那么这个E-value是什么呢?怎么来理解这个值呢?下面是一个平常的blast结果,Sequencesproducingsignificantalignments:Score(S)Egi|83574104|Moth_2374|sporulation–prote…2022e-53gi|...
对e-value值的by chance 进行解释 最近在使用blast进行序列检索的时候,有两个比较重要的评价标准,即Max score和e-value: score值很好理解,即根据不同的打分矩阵,对序列间的匹配程度进行打分,得分矩阵比如PAM和BLOSUM(氨基酸): e-value值的概念看起来就相对的比较模糊了,官方的定义是e-value:the number of hits ...
When you input an E-value in BLAST, you set up an upper-bound of E-value, any result below this value will appear. That is the reason why many sequence will apear with different E-values, and the ones with lowest values will appear at the front of all results. ...
E value：是期望值或E值，表示当在一个特定大小的数据库中搜索时，我们期望看到多少条序列能够获得同样的得分值，如E=1则可解释为在一个与刚才搜索数据库大小相近的数据库中随机搜索，我们期望还能找到1条与本序列得分相同或十分相近的序列。E值越接近0，表明该条目得分的显著性就越高，就越有可能与...