DV200质检是指对RNA样本进行质量评估的一种标准。具体来说: 一、定义 DV200是指长度大于200个核苷酸的RNA片段占总的RNA片段的百分比。这一指标是衡量FFPE(福尔马林固定石蜡包埋)样本中RNA质量的关键参数,因为FFPE样本的RNA通常会发生降解,RIN(RNA完整值)无法准确反映其质量。 二、应用 FFPE样本RNA质量评估:由于FFPE...
Extract and store the DV200 RNA Nano.xsy or DV200 RNA Pico.xsy file in the 2100 Expert Software RNA assay folder: c:\Program Files (x86)\Agilent\ 2100bioanalyzer\2100expert\assays\RNA To apply the DV200 calculation to an existing data file: Open the data file with the 2100 Expert Softw...
RNA_FFPE_DV200 A P P L I C A T I O N N O T E LabChip Microfluidics Introduction The process of fixing the tissue sample and embedding it in paraffin can cause severe degradation of the RNA.The formalin fixation process causes cross- linkage between nucleic acids and proteins, and ...
采用 Agilent RNA ScreenTape 分析法获得的 RNA 完整值当量 (RINe) 是一种评估标准 RNA 测序的样品完整性的可靠且可重现的指标。由于 RNA 降解以及样品体积有限,从福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) 组织中提取 RNA 样品进行文库制备具有挑战性,因此建议针对 FFPE RNA 文库制备采用定制方案。FFPE RNA 样品的片段大小分布...
对三个 FFPE RNA 样品进行五次独立重复测定,以对采用 RNA 和高灵敏度 RNA ScreenTape 分析法获得的 DV200重现性进行验证。两种方法均表现出较高的重现性,CV 小于 5%(图 3)。 浓度依赖性 采用RNA 和高灵敏度 RNA ScreenTape 分析法对三个单独 FFPE RNA 样品的系列稀释溶液进行分析,以确定 DV200分析的一致性...
FFPE 组织来源 RNA 的质控分级为何使用 DV 200? 经甲醛固定、石蜡包埋的 FFPE 组织提取的 RNA RIN 值一般较小,多集中在 2.0 左右,而 DV 200 值相差较大,更能反映 RNA 的实际降解程度。因此,推荐 DV 200 作为 FFPE 组织来源 RNA 的质控分级参考。
采用AgilentRNAScreenTape分析法获得的RNA完整值当量(RIN e )是一种评估标 准RNA测序的样品完整性的可靠且可重现的指标。由于RNA降解以及样品体积有 限,从福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织中提取RNA样品进行文库制备具有挑战 性,因此建议针对FFPERNA文库制备采用定制方案。FFPERNA样品的片段大小 ...
由Illumina 开发的用于 ProSize 数据分析软件的质量指标。在 TruSeq 中运行前,通过对 FFPE RNA 组织进行分析,可在测序前对福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) RNA 的质量提供无与伦比的评估。 RNA 试剂盒 (15 nt) 部件号 DNF-471 HS RNA 试剂盒 (15 nt) ...
要用DV200RNA Nano 和 DV200RNA Pico 分析运行样本: 1. 根据 RNA Nano 或 Pico 试剂盒指南制备样本和 RNA 芯片 2. 当芯片准备好并放入 2100 生物分析仪中时,转至仪器情境界面,单击分析选择,并选择对应的 DV200RNA 分析。将该分析存储于 RNA 分析文件夹中后,就成为了通用分析选择的组成部分(图 4) ...
今年3月，Frontiers in Endocrinology(IF:6.055)发表的一篇文章评估了肾上腺皮质肿瘤FFPE样本可以进行全转录组测序的效果。从本文结果来看，FFPE样本是可以用来进行RNA抽提和建库测序，且其数据结果与新鲜冻存样本的数据结果差异不大。一、样本：1、肾上腺皮质癌样本（ACC）新鲜冻存和FFPE样本各3份；2、产生醛固酮的腺瘤...