最外层key是"drugbank" ,下一层是"drug", 所有drug的信息为
数据转换完成后,通过处理 JSON 文件提取信息并存为 CSV。使用 Python 代码提取 drug id、drug name、type 及靶点的 uniprot id 和 target name,输出为 items.csv 文件。JSON 文件结构包含 "drugbank" 顶层键,下一层为 "drug",包含所有药品信息。每个 drug 包含多个标签,如 name、id、targets 等。
文件 master 该仓库未声明开源许可证文件(LICENSE),使用请关注具体项目描述及其代码上游依赖。 克隆/下载 git config --global user.name userName git config --global user.email userEmail master frequency / DrugBank_id.csv DrugBank_id.csv5.80 KB
DrugBank数据库整合了生物信息学和化学信息学资源,它将详细的药物数据与全面的药物靶标信息结合在一起。最新版的DrugBank(版本5.1.5,于2020年1月3日发布)包含13,554种药物,其中包括2,629种已批准的小分子药物,1,372种已批准的生物制剂(蛋白质,多肽,疫苗和过敏原),131种营养品和超过6,368种实验性药物(发现阶段...
DrugBank是一个全面、临床导向的药品知识和化学导向的药品数据库,由加拿大阿尔伯塔大学的David Wishart博士于2006年创立。该数据库旨在提供关于药物、药物作用机制、药物相互作用以及药物靶标的全面分子信息。自创立以来,DrugBank经历了显著的发展,于2011年成为代谢组学创新中心(TMIC)的一部分,并在2015...
查询药物的2D,3D结构,礼花常数,代谢情况,等等。http://redpoll.pharmacy.ualberta.ca/drugbank/ ...
DrugBank is a richly annotated resource that combines detailed drug data with comprehensive drug target and drug action information. Since its first release in 2006, DrugBank has been widely used to facilitate in silico drug target discovery, drug design, drug docking or screening, drug metabolism ...
Faculty Opinions recommendation of DrugBank: a comprehensive resource for in silico drug discovery and exploration. C Abad-Zapatero 被引量: 0发表: 2006年 DrugBank: a knowledgebase for drugs, drug actions and drug targets DrugBank is a richly annotated resource that combines detailed drug data ...
怎么从drugbank中找出药物的氨基酸序列啊??我研究了很久都没找到,请各位帮帮忙!
一、在寻找疾病靶点方面,drugbank和TTD等数据库的区别 1、数据来源不同 DrugBank主要以已经上市的药物为主,其数据来源包括FDA批准的药物、文献、专利和非专利报道等。TTD则是基于公开的文献、专利、临床试验等多种来源整理而成。 2、数据内容不同 DrugBank提供的信息更为全面,包括药物的化学结构、...