该参数能更好的反应测序数据的有效利用率,减少假阴性(有较高的目标区域覆盖率,但是具有较低的覆盖深度) 2、文章提出了双链RNA和单链DNA混合捕获的设想,因为不同类型探针的特征是不一致的,能更有效的降低 AT/GC dropout 5 参考文献 [1] Zhou J , Zhang M , Li X , et al. Performance comparison of fou...
2024年5月,杜克大学Fan Yuan教授团队在Advanced Drug Delivery Reviews(一区,IF=15.2)上发表题目为“A comprehensive comparison of DNA and RNA vaccines”的综述文章,系统比较了目前文献中已知的mRNA和DNA疫苗在开发时间表、财务成本、运输、疗效、安全性和产品监管批准诸多方面的优缺点,极大的方便了研究人员快速了解...
该研究收集了DNAseq检测到的24例稀有ALK融合,其中20例融合被RNAseq或IHC确认,4例未能被RNAseq或IHC确认,被RNAseq或IHC确认融合的患者相比未能被确认的患者具有更长克唑替尼的反应时间(PFS 11.0 mo vs 2.0 mo; 图6),即RNA/蛋白水平能确认的融合患者,靶向治疗才有效。
该研究收集了DNAseq检测到的24例稀有ALK融合,其中20例融合被RNAseq或IHC确认,4例未能被RNAseq或IHC确认,被RNAseq或IHC确认融合的患者相比未能被确认的患者具有更长克唑替尼的反应时间(PFS 11.0 mo vs 2.0 mo; 图6),即RNA/蛋白水平能确认的融合患者,靶向治疗才有效。
表一MET 14号外显子跳跃检测:DNAseq vs RNAseq 左侧表格为非头对头研究数据,右侧表格为头对头研究数据 泛癌人群的基因组图谱研究中,发表在国际顶级期刊Nat Biotechnol上的一篇研究对500例不同肿瘤类型的患者样本进行DNAseq和RNAseq[4],研究结果提示在泛癌人群中,相比DNAseq,RNAseq可检测出更多融合基因(图5)。
但在DNA-NGS检测定义为罕见ALK融合(非经典型融合和基型/相互型融合)患者当中,RNA-NGS/IHC检测为ALK融合阳性的患者经克唑替尼治疗后的持续缓解时间显著长于RNA-NGS/IHC检测为ALK融合阴性的患者(11.0个月 vs 2.0个月,P=0.001)(图6C),说明RNA-NGS结果能更准确预测疗效。
基于RNA水平的融合检测:NGS VS RT-PCR 在2020 WCLC及CSCO会议上,日本国家癌症中心的Koichi Goto教授展示了亚洲肺癌基因组筛查项目(LC-SCRUM-Asia)中艾德PCR-9基因产品与Oncomine™ Comprehensive Assay(OCA,161 genes NGS-panel,ThermoFisher)v3在非小细胞肺癌驱动基因变异检测的直接对比结果。因Oncomine™同样是在...
RNA is comprised of a single strand, as opposed to DNA's double strand. RNA also contains the nucleotide uracil instead of thymine. Related Links: Difference between Words Science Related Words Difference and Comparison DNA vs. RNA More Topics Handwriting Spanish Facts Examples Formulas Di...
Ambry Genetics的“+RNAinsight”产品是第一个为RNA分析提供全面基因覆盖的检测,以帮助分类和检测与各种癌症相关的DNA变异,包括乳腺癌、卵巢癌、前列腺癌、结肠癌、胰腺癌和子宫癌。该公司表示,+RNAinsight”能够更准确地识别癌症遗传风险增加的患者,找到可能被遗漏的可操作结果,并减少不确定结果的频率。
依据恒特基因RNA-NGS检测结果的疗效比较:与经典型ALK融合患者相比,无论是非经典型融合还是基型/相互型融合患者经克唑替尼治疗后的mPFS均无明显差异(11.8个月 vs 11.0个月,P=0.763;11.8个月 vs 10.0个月,P=0.442)(图6A,6B)。但在...