3.点击后进入以下页面,通过UCSC数据库可以查询该基因的基因组信息,蛋白质数据库UniprotKB相关信息,该基因在不同组织表达的RNA-seq数据,基因芯片数据,蛋白质功能域以及结构,GO富集分析等等内容。 (1)根据查询目的,比如查询基因启动子、UTR、CDS区,点击Genomic sequence。...
内含子,一般指的是真核生物基因中不编码蛋白质,是在 mRNA 加工过程中被剪切掉的 DNA 序列。这个剪切反应由“剪接体(spliceosome)”完成;剪接体的结构十分复杂,由 100 多个“零件”组成。 图1 转录过程中内含子被剪切的示意图。在真核细胞基因转录...
找到“NCBI Reference Sequences (RefSeq)”,它分为几个板块,第一个“mRNA and Protein ”区可以让我们找到连续的编码 mRNA 序列和蛋白序列。在 mRNA and Protein下面有两个序列代码(中间划有一个箭头) ,这代表了 mRNA序列和蛋白序列。分别点击就可以得到相应的序列页面。点击后如图所示,mRNA 序列: NCBI Reference...
在1978年的一篇短文中,美国科学家沃特·吉尔伯特(Walter Gilbert)提议用“intron(内含子)”指代mRNA前体中的非编码序列。mRNA是基因由DNA序列“翻译”成蛋白质序列的模板。 1980年,吉尔伯特与弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)、保罗·伯格(Paul Berg)因发明基因测序技术而共同获得诺贝尔化学奖。 断裂基因理论认为,真核...
内含子,一般指的是真核生物基因中不编码蛋白质,是在mRNA加工过程中被剪切掉的DNA序列。这个剪切反应由“剪接体(spliceosome)”完成;剪接体的结构十分复杂,由100多个“零件”组成。 图1 转录过程中内含子被剪切的示意图。在真核细胞基因转录过程中,“剪接体”行使功能将内含子去除,将外显子(绿色)组合到一起,形成...
第一部分 利用Map viewer 查找基因序列、mRNA 序列、启动子（Promoter） 下面以人的 IL6（白细胞介素 6）为例讲述一下具体的操作步骤 1． 打开Map viewer 页面， 网址为： http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mapview/index.html 在 search 的下拉菜单里选择物种，for 后面填写你的目的...
而终止密码子是在翻译过程中终止肽链合成的mRNA中的三联体碱基序列,一般情况下为UAA,UAG和UGA,不编码为氨基酸。 ATAAA ATAAA 是 preRNA 在通过修剪后形成成熟mRNA 时在3'UTR产生ployA 是的加尾信号。但是这段序列并不是绝对保守,也可能为其他A富集的序列,比如AATAAA等。 回文序列 palindrome sequence 回文序列是...
这样我们就可以找到基因的 列以及含有内cDNA序列、连续的编码 mRNA序列、蛋白序量白序列 34、如下;pvatslglll vlpajitpttFV ppqedskdva tcnlcsnmcea aJceal&ennl nlpkTLaelcd? nz fesseeqa xavcputkvl iqflkkAkn hlilr5fke qmNCBI Reference Sequences (RefSeq) 的第二个板块是 Reference assembly ,它下面显示...
2.2查找mRNA、蛋白序列 回到步骤1点击“Go”之后出现的页面,点击目的基因的名字,出现以下页面(只抓取相关部分): 页面的下半部分,即可以获取mRNA和蛋白序列的部分: 找到“NCBI Reference Sequences (RefSeq)”,它分为几个板块,第一个“mRNA and Protein”区可以让我们找到连续的编码mRNA序列和蛋白序列。在mRNA and ...
高通量测序技术的应用-DNA-seq&RNA-seq