3.点击后进入以下页面,通过UCSC数据库可以查询该基因的基因组信息,蛋白质数据库UniprotKB相关信息,该基因在不同组织表达的RNA-seq数据,基因芯片数据,蛋白质功能域以及结构,GO富集分析等等内容。 (1)根据查询目的,比如查询基因启动子、UTR、CDS区,点击Genomic sequence。...
Poly A tail由多个腺苷一磷酸组成 ,也就是说它是一段仅含有腺嘌呤碱基的RNA 。这种结构可以避免细胞质中的酶促降解,并有助于转录终止,mRNA从细胞核中的输出和翻译。 CDS(coding dna sequence) CDS 是基因中DNA或RNA为蛋白质编码区域,该区域通常开始于5‘末端的起始密码子并结束于3’端的终止密码子。生物体基...
内含子,一般指的是真核生物基因中不编码蛋白质,是在 mRNA 加工过程中被剪切掉的 DNA 序列。这个剪切反应由“剪接体(spliceosome)”完成;剪接体的结构十分复杂,由 100 多个“零件”组成。 图1 转录过程中内含子被剪切的示意图。在真核细胞基因转录...
内含子，一般指的是真核生物基因中不编码蛋白质，是在mRNA加工过程中被剪切掉的DNA序列。这个剪切反应由...
第一部分 利用Map viewer 查找基因序列、mRNA 序列、启动子（Promoter） 下面以人的 IL6（白细胞介素 6）为例讲述一下具体的操作步骤 1． 打开Map viewer 页面， 网址为： http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mapview/index.html 在 search 的下拉菜单里选择物种，for 后面填写你的目的...
⑥ 你如果觉得自己去把外显子拼起来得到CDNA序列的话,那你就out了,在NCBI Reference Sequences (RefSeq)这个选中,有 NG、NM、NP 这些你熟悉或者不熟悉的缩写,mRNA and protein(s)这里面,有剪接体的简介、剪接体之间的不同,有几个就会报道几个,很全。然后,重点是有个CCDS 这个链接,点进去 ...
2.2查找mRNA、蛋白序列 回到步骤1点击“Go”之后出现的页面,点击目的基因的名字,出现以下页面(只抓取相关部分): 页面的下半部分,即可以获取mRNA和蛋白序列的部分: 找到“NCBI Reference Sequences (RefSeq)”,它分为几个板块,第一个“mRNA and Protein”区可以让我们找到连续的编码mRNA序列和蛋白序列。在mRNA and ...
这样我们就可以找到基因的 列以及含有内cDNA序列、连续的编码 mRNA序列、蛋白序量白序列 34、如下;pvatslglll vlpajitpttFV ppqedskdva tcnlcsnmcea aJceal&ennl nlpkTLaelcd? nz fesseeqa xavcputkvl iqflkkAkn hlilr5fke qmNCBI Reference Sequences (RefSeq) 的第二个板块是 Reference assembly ,它下面显示...
FIGURE 14.1.Molecular structure of the four DNA nucleotides. Adenine and guanine are chemically similarpurines; cytosine and thymine are chemically similarpyrimidines. The first step of acquiring DNA sequence data is to identify a particular region of DNA to be compared between species. Much prior ...
找到“NCBI Reference Sequences (RefSeq)”,它分为几个板块,第一个“mRNA and Protein ”区可以让我们找到连续的编码 mRNA 序列和蛋白序列。在 mRNA and Protein下面有两个序列代码(中间划有一个箭头) ,这代表了 mRNA序列和蛋白序列。分别点击就可以得到相应的序列页面。点击后如图所示,mRNA 序列: ...