免疫共沉淀实验(Chromatin Isolation by RNA Purification, CHIRP)是一种重要的分子生物学实验技术,广泛应用于以下领域: 1. 染色质三维结构研究:CHIRP实验可用于研究RNA在染色质三维结构中的作用,揭示RNA在基因表达调控中的分子机制。 2. RNA-蛋白质相互作用研究:CHIRP实验可用于研究RNA-蛋白质相互作用,进一步探究RNA在...
siRNA介导的SETX或BRCA1缺失,增加了细胞质GFP-dRH信号,这表明了RNA-DNA杂交体在细胞质中的积累。通过细胞质DNA-RNA杂交免疫沉淀(cytoDRIP)法观察到,去除SETX或BRCA1以及使用PlaB抑制剪接,可以导致细胞质RNA-DNA杂交体的积累增加。通过siRNA介导的XPG或XPF缺失可以消除细胞质RNA-DNA杂交积累。这些结果表明,R-环的切除...
应用:ChIP可以用来检测体内反式作用因子与DNA的动态作用,还可以用来研究组蛋白的各种共价修饰与基因表达的关系。而且,ChIP与其他方法的结合扩大了其应用范围:ChIP与基因芯片相结合建立的ChIP-on-chip方法已广泛用于特定反式因子靶基因的高通量筛选;ChIP与体内足迹法相结合,用于寻找反式因子的体内结合位点;RNA-ChIP用于研...
近日,美国加利福尼亚州斯坦福大学化学与系统生物学系的研究团队在杂志《Nature》上发表了研究型的文章“R-loop-derived cytoplasmic RNA–DNA hybrids activate an immune response”(R-环衍生的细胞质RNA-DNA杂交体激活免疫应答)。 他们揭示了先天免...
近日,美国加利福尼亚州斯坦福大学化学与系统生物学系的研究团队在杂志《Nature》上发表了研究型的文章“R-loop-derived cytoplasmic RNA–DNA hybrids activate an immune response”(R-环衍生的细胞质RNA-DNA杂交体激活免疫应答)。 他们揭示了先天免疫反应的一个分支,即细胞质RNA-DNA杂交是R-环加工的免疫原性产物。
免疫沉淀法一般用于分离( )。 A. DNA B. RNA C. 蛋白质 D. 脂类 相关知识点: 试题来源: 解析 C.蛋白质 [解析]免疫共沉淀是以抗体和抗原之间的专一性作用为基础的用于研究蛋白质相互作用的经典方法。免疫共沉淀技术是确定两种蛋白质在完整细胞内生理性相互作用的有效方法。
甲醛交联的机制是DNA碱基上的氨基与亚氨基和蛋白质上的赖氨酸、精氨酸、组氨酸、色氨酸的侧链氨基均可以和甲醛发生缩合反应,分别形成共价键,最终形成甲醛连接的DNA/RNA/protein复合体。甲醛的交联是可逆反应,可以通过加热的方式解除交联,从而方便后续的DNA分析。
RIP是一种RNA结合蛋白免疫沉淀技术,用于检测RNA结合蛋白与其靶RNA之间相互作用,以蛋白为主角。 RIP的基本原理是用抗体或表位标记物捕获细胞核内或细胞质中内源性的RNA结合蛋白,防止非特异性的RNA的结合,免疫沉淀把RNA结合蛋白及其结合的RNA一起分离出来,结合的RNA序列通过microarray(RIP-Chip)、定量RT-PCR或高通量测序...
实验方法:RNA-Seq的实验流程通常包括RNA提取、文库构建、高通量测序和数据分析等步骤。而甲基化测序则需要特定的实验方法,如甲基化DNA免疫共沉淀(MeDIP)或全基因组重亚硫酸盐甲基化测序(WGBS)等,以获取甲基化信息。 数据分析:RNA-Seq的数据分析主要关注基因表达量、转录本结构、变异位点等,而甲基化测序的数据分析则...
从整个实验过程来看,在RIP里面没有像ChIP里面那样,有一个超声打断长染色质片段的步骤,分离得到的RNA理论上应该是保持了原有的长度。但是虽然整个反应系统是要求严格无RNase干扰的,RNA本身的一些不稳定性可能会有一些影响。 最主要的还需要根据你分离的目标RNA有关,如果本身抗体捕获的蛋白就只能和microRNA或小RNA结合,...