通过Western Blot、银染或质谱分析 Input 样品和实验组中的蛋白质差异,可以评估实验的有效性和特异性。 总结来说,Input 对照是指实验开始时未经过处理的样本,用来帮助确定实验过程中是否有非特异性的蛋白质或分子结合,从而作为实验结果的参考。 7. DNA pull-down实验中每个组分的作用 在DNA pull-down实验中,涉及的...
(1)预先混合1 µg DNA探针和70 µg核蛋白,置于冰上;(2)取50 µl Bioeast Mag-SA,用冰冷PBS洗一次,5000×g 离心30秒;(3)将DNA与蛋白的混合物加到Bioeast Mag-SA中,重悬珠子;(4)4℃孵育1小时;(5)5000×g,离心30秒,去除上清,收集沉淀;(6)用冰冷PBS洗Bioeast Mag-SA三次,5000×g 离心1分钟...
(2)转膜:转膜为恒流转膜,电流为200mA,时间根据目的蛋白分子量选择60~120分钟;(3)电泳:实验采用不连续系统蛋白质SDS-PAGE,浓度为5%浓缩胶和8~12%浓度分离胶;每孔上样40~60ug总蛋白,开始电压为100v,到达分离胶后调为120v;(4)孵育一抗:根据蛋白Marker指示将PVDF膜剪开,参考一抗浓度;将PVDF膜分别放入含各自一...
DNA pull-down MS制备DNA探针探针电泳图40工作日1、实验样本2、含有目标DNA序列的质粒模板及测序文件3、实验信息表(样本信息、目标DNA序列) DNA pull down捕获目标DNA片段及其结合蛋白(2组:实验组、对照组)pull down实验报告 SDS-PAGE评估DNA pull down产物中的蛋白含量和数量SDS-PAGE银染检测图 LC-MS/MS定性检测...
DNA Pull down 实验的基本步骤 1. DNA探针的设计和标记:设计含有感兴趣的特定序列的双链DNA探针。通常,探针末端会附加一个标签,用于后续捕获,如生物素(biotin)标记。2. 固相载体结合:将标记有生物素的DNA探针与链霉亲和素(streptavidin)偶联的琼脂糖珠(或磁珠)结合,生物素-链霉亲和素的强相互作用使DNA...
DNA拉下实验(DNA Pull-down)是体外研究DNA与蛋白互作的有效方法,可以探究DNA与转录调控蛋白质的互作,最常见的应用是寻找某特定基因启动子的转录因子。DNA Pull-down MS原理 将生物素标记的DNA片段结合在链霉亲和素磁珠上,形成磁珠-DNA探针复合体,再与细胞核蛋白孵育,这可以将与DNA结合的蛋白吸附在磁珠上。
DNA Pull-down的缺点 1、长链探针往往存在非特异结合现象;2、反应条件要求无核酸酶;3、体外实验,相对体内实验存在一定弊端。客户下单及项目信息填写 在我司官网http://www.biorun.com/进行注册或登录,请客户按照页面提示填写项目名称、选择项目类型、填写个人信息及联系方式,提交项目所需要的具体信息,包括:1、...
操作步骤: 1.探针制备: a.对于研究的启动子靶标区域比较明确,且长度较短的DNA片段,可以直接合成并标记上生物素作为pull down探针。 b. 对于研究的启动子靶标区域没具体预测区域,一般针对基因上游2000bp序列设计引物,并标记上生物素;然后通过 PCR 扩增的方式钓取 基因上游2000bp序列,回收纯化后作为DNA pull down的...
A:理论上说,若DNA单链能够与磁珠上的互补链杂交成功,是可以进行pull down实验的; 效率如何不好确定,这个取决于两条DNA单链是否能杂交成功、蛋白-DNA结合的强弱、蛋白的丰度等。 Q2: DNA pull down的 原理? A:针对目标区域设计特异性DNA探针并进行生物素标记,生物素探针可与偶联在磁珠上的链霉亲和素结合;细胞...