在本文中,我们报告了在AlphaFold建模的新迭代方面的进展,最新推出的模型(AlphaFold-latest)极大地扩展了该方法的适用范围,能够预测包括蛋白质、核酸、小分子、离子和修饰残基在内的复合物的联合结构。在大多数情况下,新的 AlphaFold 模型相比以前的专业工具大大提高了准确性:蛋白质-配体相互作用的准确性远高于最先进的...
AlphaFold 是单链蛋白预测的根本性突破。AlphaFold-Multimer 随后扩展到具有多个蛋白质链的复合物,随后是AlphaFold2.3,它提高了性能并将覆盖范围扩大到更大的复合物。2022 年,AlphaFold 与 EMBL 的欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)合作,通过 AlphaFold 蛋白质结构数据库免费提供了几乎所有科学界已知的已编目蛋白质...
上图显示了三个示例,其中AlphaFold-latest实现了准确的预测,但对接工具Vina和Gold却没有。 这里确认了先前观察到的尝试使用经典对接工具对接AlphaFold 2.3蛋白质结构的性能不佳;相反,在联合预测蛋白质和配体位置时,AlphaFold-latest可以对这些结合结构做出更好的预测。 上图比较了PoseBusters工具返回的各种质量检查。请注意...
上图显示了三个示例,其中AlphaFold-latest实现了准确的预测,但对接工具Vina和Gold却没有。 这里确认了先前观察到的尝试使用经典对接工具对接AlphaFold 2.3蛋白质结构的性能不佳;相反,在联合预测蛋白质和配体位置时,AlphaFold-latest可以对这些结合结构做出更好的预测。 上图比较了PoseBusters工具返回的各种质量检查。请注意...
【新智元导读】今天,DeepMind公布了AlphaFold的最新版本,不仅预测蛋白质结构的准确性大大提高,而且获得了预测RNA等新的能力。 就在今天,DeepMind公布了AlphaFold最新进展——「AlphaFold-latest」。 根据DeepMind最新发布的技术报告,新一代的AlphaFold不仅仅能够以更高的准确性处理和预测蛋白质的结构。
在大多数情况下, AlphaFold-latest 比以前的专业工具大大提高了准确性:蛋白质-配体相互作用的准确性优于最先进的对接工具,蛋白质-核酸相互作用的准确性优于 RoseTTA2FoldNA 等专业预测模型,抗体-抗原预测准确性比 AlphaFold-Multimer 显著提高。 该模型扩展的功能和性能有助于加速生物医学突破并实现「数字生物学」的...
新一代AlphaFold提前剧透 具体来看看新版AlphaFold实现的新功能。 「AlphaFold-latest」目前还是一个预览阶段,开发还没有完成,但在预测蛋白质结构之外的更广泛的任务中的表现出了惊人的性能。 「AlphaFold-latest」是在2022年底的AlphaFold 2.3版本的基础上搭建的,对于蛋白质结构的预测,特别是结合了抗体结构的类别,有着更...
「AlphaFold-latest」目前还是一个预览阶段,开发还没有完成,但在预测蛋白质结构之外的更广泛的任务中的表现出了惊人的性能。 「AlphaFold-latest」是在2022年底的AlphaFold 2.3版本的基础上搭建的,对于蛋白质结构的预测,特别是结合了抗体结构的类别,有着更好的性能。
新版模型 AlphaFold-latest (暂称)极大地扩展了应用范围,能够预测包括蛋白质、核酸、小分子、离子和修饰残基在内的复合物的联合结构。这些不同的结构类型和复合物对于理解细胞内的生物机制至关重要。 在大多数情况下, AlphaFold-latest 比以前的专业工具大大提高了准确性:蛋白质-配体相互作用的准确性优于最先进的对接...
据新智元报道,11 月 1 日,谷歌 DeepMind 公布了 AlphaFold 最新进展——AlphaFold-latest。根据 DeepMind 最新发布的技术报告,新一代的 AlphaFold 不仅仅能够以更高的准确性处理和预测蛋白质的结构。它还能将相似的能力推广到核酸、任意小分子配体等其他的生物分子结构上